Поскольку многие используют эту серию видео как справочник по командам и функциям ImageJ, сделал общее оглавление для всех видеосюжетов со ссылками на отдельные части: dzen.ru/a/ZFezUxF6lnJ9ZZVV
Юрий добрый день, посмотрела кучу роликов обущающих работать в imageJ, пытаюсь найти размер частиц на изображении с оптического микроскопа, но частицы эти оптически прлзрачные и имеют только границу раздела фаз, уже сколько бьюсь, проанализировать корректно не выходит, подскажите что можно предпринять?
Не видя снимка, конечно сложно что-либо посоветовать, но если я правильно понимаю, то Вы отличаете на изображении прозрачные частицы от прозрачного окружающего их вещества благодаря тому, что у них есть границы, отличающиеся от всего остального по уровню сигнала. Если это так, то самое простое - это использовать выделение по уровню сигнала Image -> Adjust -> Threshold (или Color Threshold) , чтобы выделить границы частиц, затем преобразовать их в бинарное изображение нажав Apply, или Process -> Binary -> Make Binary. В результате получится изображение, на котором границы частиц будут белые на черном (или наоборот, в зависимости от настроек Binary). К этому изображению можно применить функцию Process -> Binary -> Fill Holes. В результате те частицы, граница которых на полученном изображении замкнута, то есть не имеет разрывов, будут закрашены по всей площади. Дальше можно их найти, используя стандартный Analyze Particles, добавить в менеджер выделений и при необходимости проанализировать исходное изображение, используя эти выделенные области.
Поскольку многие используют эту серию видео как справочник по командам и функциям ImageJ, сделал общее оглавление для всех видеосюжетов со ссылками на отдельные части: dzen.ru/a/ZFezUxF6lnJ9ZZVV
Юрий добрый день, посмотрела кучу роликов обущающих работать в imageJ, пытаюсь найти размер частиц на изображении с оптического микроскопа, но частицы эти оптически прлзрачные и имеют только границу раздела фаз, уже сколько бьюсь, проанализировать корректно не выходит, подскажите что можно предпринять?
Не видя снимка, конечно сложно что-либо посоветовать, но если я правильно понимаю, то Вы отличаете на изображении прозрачные частицы от прозрачного окружающего их вещества благодаря тому, что у них есть границы, отличающиеся от всего остального по уровню сигнала. Если это так, то самое простое - это использовать выделение по уровню сигнала Image -> Adjust -> Threshold (или Color Threshold) , чтобы выделить границы частиц, затем преобразовать их в бинарное изображение нажав Apply, или Process -> Binary -> Make Binary. В результате получится изображение, на котором границы частиц будут белые на черном (или наоборот, в зависимости от настроек Binary). К этому изображению можно применить функцию Process -> Binary -> Fill Holes. В результате те частицы, граница которых на полученном изображении замкнута, то есть не имеет разрывов, будут закрашены по всей площади. Дальше можно их найти, используя стандартный Analyze Particles, добавить в менеджер выделений и при необходимости проанализировать исходное изображение, используя эти выделенные области.