PyMOL | Molecular Visualization System | Basic & Advance Tutorial | Lecture 27 | Dr. Muhammad Naveed

แชร์
ฝัง
  • เผยแพร่เมื่อ 26 ม.ค. 2025

ความคิดเห็น • 92

  • @yugandharmaurya6568
    @yugandharmaurya6568 ปีที่แล้ว +2

    You are the best teacher.
    Bhagwaan apko lambi umra de. 🙏🙏🙏🙏🙏🙏

  • @alirejwankabir8133
    @alirejwankabir8133 4 หลายเดือนก่อน

    Sir will you tell me how to visualize other bonds like salt bridge, pi-pi interaction, van der waal interaction in pymol.. in protein-protein or protein-ligand interaction complex

  • @Strangerthingseggos124
    @Strangerthingseggos124 5 หลายเดือนก่อน

    excellent and easy to understand tutorial.

  • @suruchibhambri_3599
    @suruchibhambri_3599 3 หลายเดือนก่อน

    Can we use .xtc file in pymol?

  • @FarhanHaqj
    @FarhanHaqj 4 ปีที่แล้ว +2

    I follow your videos. You are doing good masha Allah !

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  4 ปีที่แล้ว

      welcome dear

    • @aiworld661
      @aiworld661 ปีที่แล้ว

      WHERE WE CAN DOWNLOAD PROTEIN LIGAND FILE?@@Prof.Dr.MuhammadNaveed

  • @Tahamina-tamanna5697
    @Tahamina-tamanna5697 ปีที่แล้ว

    Greetings sir.
    In the sequence selection, which one I need to select ? Do I have to select the last one ?

  • @maheshswami5226
    @maheshswami5226 4 ปีที่แล้ว +3

    You are the best sir ,love you from Haryana 🥰🥰

  • @ShakirUllah-l9e
    @ShakirUllah-l9e 6 หลายเดือนก่อน

    ASA. Sir do you have the free PyMol. If you have please send the link. I will be thankful to you. I have downloaded but on trial basis.

  • @anamikagupta4153
    @anamikagupta4153 3 ปีที่แล้ว +1

    Hello sir. Can you pls tell while doing protein protein interaction active site prediction. We have to write 5 amestrong??? Or it was just for protein ligand active site

  • @dr.shivanshunarayanmishra
    @dr.shivanshunarayanmishra 10 หลายเดือนก่อน

    Sir please give the link for ligand

  • @whatsnew14
    @whatsnew14 2 ปีที่แล้ว

    Sir hummare protein main koi ligand ni show ho rha what I will do na koi active sides

  • @komalaslam816
    @komalaslam816 3 ปีที่แล้ว +2

    I have a question... I am doing class assignment and I have to visualise the mutated protein but I don't know how to visualise it... Can you please guide me sir

  • @shugalmela4808
    @shugalmela4808 2 ปีที่แล้ว

    Sir plzz mutagensis kesy kr skty h by using pymol

  • @rabiapervaiz9804
    @rabiapervaiz9804 11 หลายเดือนก่อน

    Way of explanation is excellent

  • @sheikhatikaali131
    @sheikhatikaali131 5 หลายเดือนก่อน

    Sir ye pymol livcon use kr skte h na
    Ya aise dawa batao upar wale ka wasta aaapko sirr ke masse chale jaye bht preshaan ho dr bht zyadaaa 😢😢😢😢

  • @samieermadavi1150
    @samieermadavi1150 3 ปีที่แล้ว +1

    Mera accident hogya tha to muzhe 1 mahine tak hospital me hi rahna pada, tb se meko moshanke jaga higher antibiotics ke wajese muzhe achank se bloding aur Mase moshan ke time jalan horha tha to mayne you tube kisi ki comment padke pymol+ livcon capsule and manulax churna magwaya aur 2 mahne continue kiya ab muzhe koi bhi takhalif nhi he,mai ese amazon se mangwata tha •••

  • @prachigupta624
    @prachigupta624 3 ปีที่แล้ว +1

    Muzhe bohat jayda Jagran aur kamjori ke karan Piles ki takhalif aur blooding bohat jayda hota tha FIR mayne amezon se pymol+Livcon capsule aur manulax churna magwaliya meri blooding 3din me rukha gya aur Piles ki takhalif bhi khatam hogyi, do maheene me complete aram ho gaya •••

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  3 ปีที่แล้ว

      not relevant

    • @samieermadavi1150
      @samieermadavi1150 3 ปีที่แล้ว +1

      Ha ji mayne bhi use kiya pymol+livcon capsule and manulax churna bohat acha result he iska;;:

    • @faisfaisal9457
      @faisfaisal9457 3 ปีที่แล้ว

      @@samieermadavi1150 sir plz manulax churna kanha mile ga baii plz batado

  • @dazzlingqueen8712
    @dazzlingqueen8712 2 ปีที่แล้ว

    Sir, Where can I find the type of bonding among interacted residues while protein-ligand interaction analysis in PyMOL?

  • @ashokbehera7152
    @ashokbehera7152 3 ปีที่แล้ว +1

    Hello Naveed ji nice one but you must have done the result analysis, interacting amino acids, 2D and 3D structure plot and how to design small molecules and peptides from this interaction it could be much more useful really, waiting for ur videos and reply
    Regards
    ashok

  • @tahirbutt8314
    @tahirbutt8314 4 ปีที่แล้ว +1

    sir kindly tell me which protein-ligand interaction explain here???

  • @aroosafarooq6838
    @aroosafarooq6838 3 ปีที่แล้ว +1

    Screen pr top right pr or neechy jo bar a rha ha apka wo irritating ha. Kindly usko hata den full screen show ho to behter ha.

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  3 ปีที่แล้ว

      try to maximize screen

    • @aroosafarooq6838
      @aroosafarooq6838 3 ปีที่แล้ว

      Sir full screen pr b ata ha

    • @yashmishra6823
      @yashmishra6823 3 ปีที่แล้ว +1

      Meko pichale 1 year se piles ki takhailf chalu Hui muzhe kuch samjta nhi tha is bimarike bare me mayne uske taraf jayda kucha gour nhi kiya par moshan ke time blooding aur thoda thoda mass jaysa lagta tha mayne uske tarf jayda dhan nhi diya meri takhalif bohat badte gya aur dard bohat hone laga Mayne amezon pe piles ki dawa sarch Kiya to pymol+Livcon capsule and manulax churna se review dekhake to mangwaake suru kia,muze ye medicine se complete Aram mila, best medicine hai piles ke liye """"

    • @prachigupta624
      @prachigupta624 3 ปีที่แล้ว +1

      @@yashmishra6823 ha ji mayne bhi use kiya pymol+livcon capsul and manulax chruna bohat acha result he iska ××÷

    • @samieermadavi1150
      @samieermadavi1150 3 ปีที่แล้ว

      @@prachigupta624 sachme pymol+livcon capsule and manulax churna bohat acha result he iska ;::

  • @asalamtarakvadiya7709
    @asalamtarakvadiya7709 2 ปีที่แล้ว

    सर पाइल्स के लिए पाइमोल लीवह कौन का इस्तेमाल कर सकते हैं क्या वह अच्छा रिजल्ट वाली मेडिसिन है, जरूर बताईऐगा

  • @basitsharif5327
    @basitsharif5327 3 ปีที่แล้ว +1

    hi...brother can we find the dimensions of enzyme using enzyme structure???

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  3 ปีที่แล้ว

      yes you can

    • @basitsharif5327
      @basitsharif5327 3 ปีที่แล้ว

      Can you please guide me how?

    • @basitsharif5327
      @basitsharif5327 3 ปีที่แล้ว

      Usong pymol

    • @basitsharif5327
      @basitsharif5327 3 ปีที่แล้ว

      I want to find the size of enzyme and active site using pymol, but i didn't found any video related to it..

    • @basitsharif5327
      @basitsharif5327 3 ปีที่แล้ว

      It is a humble request if you can guide me this or help me in this regard

  • @apnagaonapnadesh5842
    @apnagaonapnadesh5842 3 ปีที่แล้ว

    sir i am the regular viewer of your video. your all video are very knowledgeable and easy to understand.
    I like you to make a video on Gromacs
    thank you sir

  • @cleanursoul6502
    @cleanursoul6502 2 ปีที่แล้ว

    Fishar k liye kaisa h sir mujhe takleef h boht

  • @SuperSupergenious
    @SuperSupergenious 4 ปีที่แล้ว +1

    very good explaination sir. Kindly also explain how to calculate RMSD in Pymol?

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  4 ปีที่แล้ว +1

      Noted and sure will do in coming lectures

    • @noorussaba7370
      @noorussaba7370 ปีที่แล้ว

      Sir I have a question, why from pdb website proteins are not downlaod in pdf formate

  • @rabiaameen7018
    @rabiaameen7018 3 ปีที่แล้ว +1

    Sir sequence enter Krny se wo ni AA Ra...any solution?

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  3 ปีที่แล้ว

      upload solution or complex file rather than a sequence

    • @yashmishra6823
      @yashmishra6823 3 ปีที่แล้ว +1

      Meko pichale 1 year se piles ki takhailf chalu Hui muzhe kuch samjta nhi tha is bimarike bare me mayne uske taraf jayda kucha gour nhi kiya par moshan ke time blooding aur thoda thoda mass jaysa lagta tha mayne uske tarf jayda dhan nhi diya meri takhalif bohat badte gya aur dard bohat hone laga Mayne amezon pe piles ki dawa sarch Kiya to pymol+Livcon capsule and manulax churna se review dekhake to mangwaake suru kia,muze ye medicine se complete Aram mila, best medicine hai piles ke liye ;;;;

    • @samieermadavi1150
      @samieermadavi1150 3 ปีที่แล้ว +1

      @@yashmishra6823 ha ji mayne bhi use kiya pymol+livcon capsule and manulax churna bohat acha result he iska ;;;

  • @sanjaisrao484
    @sanjaisrao484 3 ปีที่แล้ว +1

    Excellent

  • @VINODYADAV-oj5ww
    @VINODYADAV-oj5ww 2 ปีที่แล้ว

    Sir pilonidal since me bhi le sakte h kya

  • @watchandenjoy5658
    @watchandenjoy5658 3 ปีที่แล้ว

    Fistula ki problem pe kiya pymol + livcon manulax churna results accha deta ha kiya ...please tell me .... Mera bhut problem ho raha ha

  • @hitkarshkushwaha2434
    @hitkarshkushwaha2434 4 ปีที่แล้ว +1

    Nice job

  • @syedaadeen9273
    @syedaadeen9273 4 ปีที่แล้ว +1

    Good lecture sir

  • @srinivasagowda5643
    @srinivasagowda5643 3 ปีที่แล้ว

    Sir piles ke liye kya treatment sir

  • @yashmishra6823
    @yashmishra6823 3 ปีที่แล้ว +2

    Meko pichale 1 year se piles ki takhailf chalu Hui muzhe kuch samjta nhi tha is bimarike bare me mayne uske taraf jayda kucha gour nhi kiya par moshan ke time blooding aur thoda thoda mass jaysa lagta tha mayne uske tarf jayda dhan nhi diya meri takhalif bohat badte gya aur dard bohat hone laga Mayne amezon pe piles ki dawa sarch Kiya to pymol+Livcon capsule and manulax churna se review dekhake to mangwaake suru kia,muze ye medicine se complete Aram mila, best medicine hai piles ke liye ~~~

    • @Prof.Dr.MuhammadNaveed
      @Prof.Dr.MuhammadNaveed  3 ปีที่แล้ว

      its not medicine dear

    • @prachigupta624
      @prachigupta624 3 ปีที่แล้ว +1

      Ha ji mayne bhi use kiya pymol+livcon capsul and manulax chruna bohat acha result he iska ~~

    • @samieermadavi1150
      @samieermadavi1150 3 ปีที่แล้ว +1

      @@prachigupta624 sachme pymol+livcon capsule and manulax churna bohat acha hai ;;;

    • @ummyayman5159
      @ummyayman5159 2 ปีที่แล้ว

      @@Prof.Dr.MuhammadNaveed mdcn ni h to kiabh plz btaen am from pakistan from punjab plz tell mjy piles h mene b order krna h plz bta den

    • @gituchandra1436
      @gituchandra1436 2 ปีที่แล้ว

      ye masse wala piles pymol,livicon,or manulax dwa se ,,,जड़ se khatm hota h kya ,, plzz rply me fast

  • @hitkarshkushwaha2434
    @hitkarshkushwaha2434 4 ปีที่แล้ว +1

    Love from 🇮🇳

  • @apnagaonapnadesh5842
    @apnagaonapnadesh5842 3 ปีที่แล้ว

    THANK YOU SIR

  • @komalaslam816
    @komalaslam816 3 ปีที่แล้ว +1

    Wanna ask you something

  • @harshadlonare8698
    @harshadlonare8698 3 ปีที่แล้ว

    Use kaise karte hai

  • @ramneetkaur2500
    @ramneetkaur2500 4 ปีที่แล้ว +1

    Great explanation.

  • @komalaslam816
    @komalaslam816 3 ปีที่แล้ว

    A.o.a sir

  • @anshikadubey7379
    @anshikadubey7379 3 ปีที่แล้ว

    Ye dawa hm kha sakte h sir babasir me hmesa ke liye sahi ho jayega

  • @deepakkushwah4157
    @deepakkushwah4157 3 ปีที่แล้ว

    सर मुझे मस्से की प्रोवलम है, बहुत परेशान हूं, कृप्या इलाज बताएं🙏🙏😔😔

  • @ersipierspier1733
    @ersipierspier1733 4 ปีที่แล้ว

    13:43 I love that. Do you love me? 😍💋 💝💖❤️