eu tenho uma duvida. eu uso o image j para obter o perímetro de colonias de corais, mas esses dias esta me ocorrendo um problema, quando salvo a img depois de analisada e abro ela no image j novamente todos os perímetros analisados ficam desordenados, como se tivesse dado um bug na img, vcs tem ideia do que possa ser ?
Parabéns pelo vídeo. Me ajudou muito. Mas tenho 2 dúvidas. No vídeo mostrou como conta as células mais escuras, como seria para contar as mais claras? E quando a imagem não está tão nítida quanto a diferença de cores, como posso ajustar para o software não contar essas células que "tem riscos de preto" mas que na verdade são brancas?
Obrigado! 1-) O passo adicional antes de usar os mesmos procedimentos apresentados aqui para contar as células mais claras seria apenas o de inverter sua imagem com o comando "Edit > Invert". Isso transformará o que está claro em escuro e vice-versa em todos os frames do seu filme. Talvez você tenha que duplicar o seu vídeo no ImageJ antes de aplicar esta tarefa, pois o ImageJ não permitirá desfazer. 2-) Então... quando a imagem não está muito nítida quanto as cores será necessário alguns "dons artísticos" no pré-processamento dos vídeos. Sugiro os seguintes comandos: Image > Adjust > Brightness/Contrast Image > Adjust > Auto Local Threshold Image > Adjust > Auto Threshold Image > Adjust > Threshold
Apenas com este procedimento não, até porque existem muitos tipos de células e coisas que podem ser distintas de células e o algoritmos não faz diferença entre elas. Por outro lado a tabela de saída te fornece parâmetros de reconhecimento dos objetos, como alongamento, tamanho, etc. Filtrando esta tabela você deve conseguir fazer a contabilidade do que deseja.
Olá! Quero tirar uma dúvida como faço para medir algo específico na imagem, pq estou utilizando uma imagem que tem muitas informações, porém eu quero medir algo específico, ex.: medir apenas um ponto, enquanto tem vários pontos diferentes disposto na imagem?
@@astutos-ufs Assistir esse vídeo também, é pq tenho várias fotos, e apenas uma que tirei com a escala, as outras foram sem escala. Queria vê a possibilidade de medir as outras sem ter a necessidade de retirar todas as fotos novamente com escola. E as imagens só tem dois ou três pontos que é o foco da pesquisa. =/
@@laianatrindade8974 Existem elementos comuns entre a imagem que você tirou com escala e as outras que estão sem escala? Por exemplo um arranhão na lâmina, ou células que tenham mais ou menos o mesmo tamanho. Assim você pode medi-los na imagem com escala e utilizá-lo na imagem sem escala como calibradores secundários.
Hello ! Can you explain ,how to find the maximum and minimum diameter of inclusions and volumetric content of the nano-particles using image j? Thanks a lot .
Hi! I have some ideas on how to deal with this problem using the content of the video. Considering that in only one picture you just have a bidimensional projection of your nano-particles, the best you can do are some estimates on their volumetric content, based on the information you have available in this picture and the overall symmetry of your targets. Let's suppose you have objects with circular symmetry (as in this videos) and they result from a spherical symmetry. You can extract a list of diameters (d) and with an spreadsheet calculate the volume of all lines in a new column using the formula V=4/3*pi*(d/2)^3. Then you can filter the maximum and minimum of the new column or order it in ascending or descending order. ATTENTION: For erythrocytes the spherical symmetry is not a good idea.
Na janela "Analyze Particles", no menu "Show" escolha "Outline". O procedimento funcionará para qualquer objeto alvo, desde que exista alguma estrutura univoca em cada célula com contraste suficiente entre elas.
Olá, gostei de sua explicação por que foi bem objetiva. Gostaria de saber o que significa os atributos AR, Round e solidity e qual a diferença entre eles, você sabe me dizer?
Sim.. O mais simples é selecionar a tabela inteira na janela de resultados, copiar o conteúdo a combinação de teclas CTRL+C e colar o resultado no excel com CTRL+V. Outro procedimento é acessar o menu File, na janelas de resultados, escolher a opção "Save as..." e o formato será o csv (comma separated value), ou seja de valores separados por vígula. Aí seguindo os procedimentos em th-cam.com/video/XsEr91r7fHc/w-d-xo.html escolhendo que o separador no Excel sejam virgulas.
Para encontrar partículas com no mínimo 300 pixel^2 e evitar fragmentos ou células parcialmente registradas. Isso pode ser estimado medindo-se a menor das células visíveis.
Bem direto, adorei!!
hola como es posible contar partículas de formas irregulares como por ejemplo microplasticos cual seria la herramienta a usar
El recurso presentado en el video es util para cualquier forma irregular, desde que se pueda separarlas o que hay un alto contraste entre las formas.
eu tenho uma duvida. eu uso o image j para obter o perímetro de colonias de corais, mas esses dias esta me ocorrendo um problema, quando salvo a img depois de analisada e abro ela no image j novamente todos os perímetros analisados ficam desordenados, como se tivesse dado um bug na img, vcs tem ideia do que possa ser ?
Parabéns pelo vídeo. Me ajudou muito. Mas tenho 2 dúvidas. No vídeo mostrou como conta as células mais escuras, como seria para contar as mais claras? E quando a imagem não está tão nítida quanto a diferença de cores, como posso ajustar para o software não contar essas células que "tem riscos de preto" mas que na verdade são brancas?
Obrigado! 1-) O passo adicional antes de usar os mesmos procedimentos apresentados aqui para contar as células mais claras seria apenas o de inverter sua imagem com o comando "Edit > Invert". Isso transformará o que está claro em escuro e vice-versa em todos os frames do seu filme. Talvez você tenha que duplicar o seu vídeo no ImageJ antes de aplicar esta tarefa, pois o ImageJ não permitirá desfazer. 2-) Então... quando a imagem não está muito nítida quanto as cores será necessário alguns "dons artísticos" no pré-processamento dos vídeos. Sugiro os seguintes comandos:
Image > Adjust > Brightness/Contrast
Image > Adjust > Auto Local Threshold
Image > Adjust > Auto Threshold
Image > Adjust > Threshold
Parabéns,pelo video
Oi, teria como quantificar justamente o oposto, tudo o que não for célula?
Apenas com este procedimento não, até porque existem muitos tipos de células e coisas que podem ser distintas de células e o algoritmos não faz diferença entre elas. Por outro lado a tabela de saída te fornece parâmetros de reconhecimento dos objetos, como alongamento, tamanho, etc. Filtrando esta tabela você deve conseguir fazer a contabilidade do que deseja.
Olá!
Quero tirar uma dúvida como faço para medir algo específico na imagem, pq estou utilizando uma imagem que tem muitas informações, porém eu quero medir algo específico, ex.: medir apenas um ponto, enquanto tem vários pontos diferentes disposto na imagem?
Oi Lay. Talvez este outro vídeo possa te ajudar para uma medida específica. th-cam.com/video/z-nAZEi4W80/w-d-xo.html
@@astutos-ufs Assistir esse vídeo também, é pq tenho várias fotos, e apenas uma que tirei com a escala, as outras foram sem escala. Queria vê a possibilidade de medir as outras sem ter a necessidade de retirar todas as fotos novamente com escola. E as imagens só tem dois ou três pontos que é o foco da pesquisa. =/
@@laianatrindade8974 Existem elementos comuns entre a imagem que você tirou com escala e as outras que estão sem escala? Por exemplo um arranhão na lâmina, ou células que tenham mais ou menos o mesmo tamanho. Assim você pode medi-los na imagem com escala e utilizá-lo na imagem sem escala como calibradores secundários.
Hello ! Can you explain ,how to find the maximum and minimum diameter of inclusions and volumetric content of the nano-particles using image j? Thanks a lot .
Hi! I have some ideas on how to deal with this problem using the content of the video. Considering that in only one picture you just have a bidimensional projection of your nano-particles, the best you can do are some estimates on their volumetric content, based on the information you have available in this picture and the overall symmetry of your targets. Let's suppose you have objects with circular symmetry (as in this videos) and they result from a spherical symmetry. You can extract a list of diameters (d) and with an spreadsheet calculate the volume of all lines in a new column using the formula V=4/3*pi*(d/2)^3. Then you can filter the maximum and minimum of the new column or order it in ascending or descending order. ATTENTION: For erythrocytes the spherical symmetry is not a good idea.
Bom dia, como você colocou o nome Glóbulos Vermelhos? E se eu quiser quantificar número de células ósseas?
Na janela "Analyze Particles", no menu "Show" escolha "Outline". O procedimento funcionará para qualquer objeto alvo, desde que exista alguma estrutura univoca em cada célula com contraste suficiente entre elas.
Olá, gostei de sua explicação por que foi bem objetiva. Gostaria de saber o que significa os atributos AR, Round e solidity e qual a diferença entre eles, você sabe me dizer?
É possível exportar as informações para o excel?
Sim.. O mais simples é selecionar a tabela inteira na janela de resultados, copiar o conteúdo a combinação de teclas CTRL+C e colar o resultado no excel com CTRL+V. Outro procedimento é acessar o menu File, na janelas de resultados, escolher a opção "Save as..." e o formato será o csv (comma separated value), ou seja de valores separados por vígula. Aí seguindo os procedimentos em th-cam.com/video/XsEr91r7fHc/w-d-xo.html escolhendo que o separador no Excel sejam virgulas.
Isso serve pra células menores também?
Sim. O procedimento é digital e com um algoritmo matemático independente de escala.
Thank you!
merci bcp
Por que vc adicionou de 300 ao infinito?
Para encontrar partículas com no mínimo 300 pixel^2 e evitar fragmentos ou células parcialmente registradas. Isso pode ser estimado medindo-se a menor das células visíveis.