This is quite an informative tutorial thank you. However, I have a question. In the index file, what selections do you make if one wants to perform SASA calculation for ligand_free system? Myself I am working with a protein complex of HSPA8 and SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Does this mean when making my selection for the index file, I select the chains that make up the protein complex??
Thank you for watching the video. Yes you are making index of both proteins. In this case, for HSPA8 and the SARS-CoV-2 spike protein, this would involve specifying the chains corresponding to these proteins while excluding solvent and non-protein molecules like ligands or ions (if present).
سلام دوست عزیز و بزرگوار من میخواستم ی پایان نامه رو به مقاله تبدیل کنم که ویدیو شمارو دیدم ، میخواستم بدونم شما قبول زحمت میکنید ؟ یا دوستی رو می تونین معرفی کنید ؟
@@al1r3z49 من در مقطع دکتری کامپیوتر درس می خونم و پایان نامه کارشناسی ارشد رو که کار کردم میخواستم به مقاله تبدیل کنم با موضوع تز دکترای من در یک راستا است
You are the best 👍
You are awesome thanks thanks and thanks.
Nice👌🏻
This is quite an informative tutorial thank you. However, I have a question. In the index file, what selections do you make if one wants to perform SASA calculation for ligand_free system? Myself I am working with a protein complex of HSPA8 and SARS-CoV-2 spike glycoprotein. Does this mean when making my selection for the index file, I select the chains that make up the protein complex??
Thank you for watching the video. Yes you are making index of both proteins. In this case, for HSPA8 and the SARS-CoV-2 spike protein, this would involve specifying the chains corresponding to these proteins while excluding solvent and non-protein molecules like ligands or ions (if present).
@al1r3z49 awesome. Thank you for the response.
Great tutorial
سلام دوست عزیز و بزرگوار من میخواستم ی پایان نامه رو به مقاله تبدیل کنم که ویدیو شمارو دیدم ،
میخواستم بدونم شما قبول زحمت میکنید ؟
یا دوستی رو می تونین معرفی کنید ؟
سلام بهزاد عزیز. لطفاً بهم بگو رشته شما چیه، و در چه مقطعی تحصیل می کنید. اینطور بهتر می توانم کمک کنم.
@@al1r3z49 من در مقطع دکتری کامپیوتر درس می خونم
و پایان نامه کارشناسی ارشد رو که کار کردم میخواستم به مقاله تبدیل کنم با موضوع تز دکترای من در یک راستا است
راستی من یک پیش نویس اولیه از مقاله رو هم تهیه کردم
سلام مجدد، برای شما آرزوی موفقیت می کنم در مراحل تصحصیلتون. متاسفانه ما در رشته شما خدمات نداریم.