Hola Jorge, Gracias por el comentario. Yo poco a poco voy subiendo videos, pero no tan frecuentes como me gustaría. Si tienes alguna duda puntual puedo hacer un video y subirlo, así puede servir para otras personas. Un saludo!
Hola, Es posible que varíe un poco la posición de barra de "effects", es posible que esté al lado izquierdo de la lista de segmentaciones o abajo(utiliza la barra de navegación para explorar toda la información que hay en el módulo). Si no la ves, expande la ventana del módulo o reiniciar Sclicer, Edit>application Settings> Restore Defaults buena suerte
Hola Hugo, EL programa tiene un módulo llamado Seguence Browser, en este modulo puedes grabar diversos movimientos de la cámara o cualquier proceso de otro módulo. más información la puedes encontrar acá: th-cam.com/video/hxYwJKgXXks/w-d-xo.html Una vez exportas el modelo 3D como se ve en este vídeo en el minuto 26:20 (th-cam.com/video/B5uGuDSGdEs/w-d-xo.html) Puedes visualizarlo en windows haciendo click derecho sobre el archivo y después elegir abrir con, y seleccionar el visualizado 3D. Trataré de subir otros casos, ¿que anatomía te interesa segmentar? Buena suerte
Es posible imprimir mi hueso en tamaño real tengo imagenes de resonancias de tomografía tengo unos 40 tornillos de titaño en tibia y peroné me gustaría imprimir tibia en 3d con sus agujeros de tornillos . Tornillos y pletinas por separado y al final poder mantar todo junto? Es posible ?
Hola Polaco, Todo depende de las imágenes médicas. Si tienes piezas metálicas, lo que te hicieron fue una Tomografía Axial Computarizada o comúnmente llamada TAC. Los TAC suelen tener buena calidad, pero los elementos metálicos suelen crear errores en la imagen que hace el proceso difícil o incluso imposible. Si tienes suerte y las imágenes se ven bien, con el programa Slicer3D podrías con relativa facilidad segmentar el hueso y los metales por separado, y después imprimirlos por separado. Lo de montarlo después va a requerir que tu con un programa de edición de modelos 3D separes los tornillos y las platinas, debido a que de las imágenes médicas, probablemente van a salir todas unidas en una sola pieza. Te invito a que descargues el programa y pruebes a hacer la primera parte tu, es muy interesante. buena suerte
Hola Leonardo, Si se pueden imprimir Ecografías 3D, pero tienes que primero asegurarte de guardar un volumen, no una imagen 3D, es el error más común cuando alguien quiere segmentar Ecografías. Cada ecografo y cada marca es muy distinta, ojalá ver si es posible exportar el archivo DICOM cartesiano. Y después usar el programa Slicer 3D para crear el modelo 3D Algunos ecografo tienen la opción de exportar directamente modelos 3D. Pero casi siempre hace falta limpiar el modelo y optimizarlo para impresión. No es un proceso sencillo. Busca tutorialses sobre cómo abrir archivos de ecografo en 3D Slicer y con este video que he hecho, puedes hacer el proceso de Segmentación. Buena suerte
Hola Luis, la segmentación de imágenes médicas depende de la calidad de las imágenes y de la información que aparece. si en una imagen logras ver con claridad lo que te interesa, lo más probable es que lo puedas segmentar y crear un modelo 3D. Si por el contrario las imágenes médicas no muestran con caridad la anatomía que te interesan, la segmentación no va a poder hacerse en modo apropiado.
@@MarcoDeRossi Buen día. Muchas gracias por contestar!!!. Tienes razón, la respuesta puede ser útil a más amigos. Soy usuario nuevo (1 semana) de 3DSlicer, me encanta el programa. Mi problema es el siguiente : seguí tu video instrucción a instrucción, pero al final no logro llegar al huesito limpio. 1.- En mi mente no queda claro (ya que no logro hacerlos funcionar bien juntos) como trabaja el comando Threshold, tampoco el comando isla , ya que no sé como elegir el intervalo para lograr evidenciar las densidades relativas y poder eliminar los elementos que no forman parte del hueso. 2.- No sé como definir para mi mismo el uso de la creación de segmen1, segment2, etc.... 3.- como comentario, seguí al pie de la letra tus indicaciones para el setting de cada parámetro. El Spacing scale no sé ajustarlo a mis necesidades. Si fuera posible, creo que nos ayudarías mucho a los novatos, definiendo el uso de las herramientas y en especial, detallando el tema de segmentación 13:23 en adelante. Muchas gracias y espero me puedas ayudar con este tema, es muy apasionante...
@@JoseLuis-vf1hj El programa S3Dlicer es un programa muy complete y lleva tiempo entender como funciona, sigue practicando y viendo vídeos y empezara a tener más sentido todo. Lo más importante es entender que la parte de segmentación depende mucho de la calidad de las imágenes médicas, muchos problemas de la segmentación suelen ser imágenes con poca resolución, artefactos metálicos o de movimiento o mucho ruido. Todo esto hace el proceso de segmentación mucho más difícil. 1. La palabra Threshold se podría traducir como RANGO, El comando Threshold sirve para segmentar (colorear) todos los voxels (píxel 3D) del volumen que están dentro de un rango de atenuación. Por ejemplo, si usas el rango completo que te da la herramienta, entonces vas a segmentar todo el volumen, pero si vas moviendo los límites, podrás ir quitando atenuación que no te interesan hasta que solo segmentaras lo que está dentro de la atenuación que quieres. Con esta herramienta puedes definir si quieres segmentar solo lo que es muy denso o poco denso, según lo que necesites. Una isla es un grupo de Voxels que están unidos, la herramienta de isla permite borrar o dejar la isla seleccionada, además de otras opciones. Esta es una herramienta muy importante pues te permite borrar todo lo que no quieres y dejar solo la isla que te interesa, o ir borrando islas que no quieres. 2. Cada segmentación es una capa de un color, y la puedes utilizar para segmentar (colorear) algunos voxels (Es muy parecido a las capas en un programa de edición de imagen 2D como Photoshop) Todo lo que esté en esa capa va a tener el mismo color, y puedes ir pintando lo que quieras dentro de esa capa. Normalmente cada capa se utiliza para segmentar una estructura anatómica o tejidos distintos, así puedes tener orden en tu trabajo. El principal problema que tiene 3DSLicer, es que por defecto, todo lo que dibujes en una capa, lo va a borrar de las otras capas donde se solape, esto lo tienes que deshabilitar en las opciones (allow overlap) Para poder aprovechar al máximo el programa, es fundamental entender como usar las diversas segmentaciones como mascaras o guías para ir coloreando lo que te interesa, esto es probablemente lo más difícil de entender y de aprender, pero al mismo tiempo es la herramienta más potente del programa. 3. El spacing scale controla la resolución del nuevo volumen después de cortar todo lo que no nos interesa con la herramienta de CROP, el valor que vas a poner ahí va a dividir la resolución de las imágenes. Es un poco confuso, porque funciona al contrario de lo que uno creería, es decir un número mayor baja la resolución, un numero menor la aumenta. Si pones 2, reducirá a la mitad la resolución, si pones 0.5, es como multiplicar por 2 la resolución. No es buena idea aumentar mucho la resolución, puedes quedar con archivos muy pesados. 0.5 suele ser lo máximo que pongo para mejorar la resolución cuando he limitado mucho la zona del volumen sobre la que voy a trabajar. Me gustaría poder hacer más vídeos, la verdad es que cuando tenga algo más de tiempo trataré de hacerlos. Explicar cada herramienta es un vídeo que he querido hacer desde hace tiempo y será el primero que haga. Si tienes cualquier duda, escríbeme sin problema, pero te recomiendo que practiques un poco y vuelvas a ver el vídeo, en el explico muchas cosas que no se aprecian viéndolo una sola vez o si no entiendes muy bien los términos y las herramientas. Buena suerte con el programa, es un campo muy complejo y muy amplio, requiere paciencia y práctica.
!!!!!!!! Eres el mejor !!!!!!!!!
!!!!!!!!!!!!Gracias!!!!!!!!!!!!!!
excelente explicación.
Hola Marco como contacto contigo
Hola, muy interesante. Se puede realizar volumetrías de áreas del cerebro? muchas gracias
Hola Marco. ¿Tienes planificado grabar mas videos de este tema? La verdad, estaría buenísimo porque este está excelente !! Abrazo grande !!!
Hola Jorge,
Gracias por el comentario.
Yo poco a poco voy subiendo videos, pero no tan frecuentes como me gustaría.
Si tienes alguna duda puntual puedo hacer un video y subirlo, así puede servir para otras personas.
Un saludo!
Hola, muy interesante. Se puede realizar volumetrías (obtener los cc ó mL) de áreas del cerebro? muchas gracias
Hola no me sale la barra de efectos en el modulo de Segmentacion, que puede ser?
Hola,
Es posible que varíe un poco la posición de barra de "effects", es posible que esté al lado izquierdo de la lista de segmentaciones o abajo(utiliza la barra de navegación para explorar toda la información que hay en el módulo).
Si no la ves, expande la ventana del módulo o reiniciar Sclicer, Edit>application Settings> Restore Defaults
buena suerte
Disculpa se puede exportar a vídeo o disco para visualizar después de trabajar con el volumen. Puedes subir algún ejemplo con demás partes del cuerpo.
Hola Hugo,
EL programa tiene un módulo llamado Seguence Browser, en este modulo puedes grabar diversos movimientos de la cámara o cualquier proceso de otro módulo. más información la puedes encontrar acá: th-cam.com/video/hxYwJKgXXks/w-d-xo.html
Una vez exportas el modelo 3D como se ve en este vídeo en el minuto 26:20 (th-cam.com/video/B5uGuDSGdEs/w-d-xo.html)
Puedes visualizarlo en windows haciendo click derecho sobre el archivo y después elegir abrir con, y seleccionar el visualizado 3D.
Trataré de subir otros casos, ¿que anatomía te interesa segmentar?
Buena suerte
Es posible imprimir mi hueso en tamaño real tengo imagenes de resonancias de tomografía tengo unos 40 tornillos de titaño en tibia y peroné me gustaría imprimir tibia en 3d con sus agujeros de tornillos . Tornillos y pletinas por separado y al final poder mantar todo junto? Es posible ?
Hola Polaco,
Todo depende de las imágenes médicas.
Si tienes piezas metálicas, lo que te hicieron fue una Tomografía Axial Computarizada o comúnmente llamada TAC.
Los TAC suelen tener buena calidad, pero los elementos metálicos suelen crear errores en la imagen que hace el proceso difícil o incluso imposible.
Si tienes suerte y las imágenes se ven bien, con el programa Slicer3D podrías con relativa facilidad segmentar el hueso y los metales por separado, y después imprimirlos por separado.
Lo de montarlo después va a requerir que tu con un programa de edición de modelos 3D separes los tornillos y las platinas, debido a que de las imágenes médicas, probablemente van a salir todas unidas en una sola pieza.
Te invito a que descargues el programa y pruebes a hacer la primera parte tu, es muy interesante.
buena suerte
@@MarcoDeRossi gracias eres un profesional voy ir aprendiendo mas y mas con tus videos gracis por crear mis pieza
Se puede imprimir ecografia 3D?
Hola Leonardo,
Si se pueden imprimir Ecografías 3D, pero tienes que primero asegurarte de guardar un volumen, no una imagen 3D, es el error más común cuando alguien quiere segmentar Ecografías.
Cada ecografo y cada marca es muy distinta, ojalá ver si es posible exportar el archivo DICOM cartesiano. Y después usar el programa Slicer 3D para crear el modelo 3D
Algunos ecografo tienen la opción de exportar directamente modelos 3D.
Pero casi siempre hace falta limpiar el modelo y optimizarlo para impresión. No es un proceso sencillo.
Busca tutorialses sobre cómo abrir archivos de ecografo en 3D Slicer y con este video que he hecho, puedes hacer el proceso de Segmentación.
Buena suerte
Se puede hacer eso con colon .
?
Hola Luis, la segmentación de imágenes médicas depende de la calidad de las imágenes y de la información que aparece.
si en una imagen logras ver con claridad lo que te interesa, lo más probable es que lo puedas segmentar y crear un modelo 3D.
Si por el contrario las imágenes médicas no muestran con caridad la anatomía que te interesan, la segmentación no va a poder hacerse en modo apropiado.
saludos. hay algun correo o whatsapp donde pueda preguntarte algunos detalles?
Hola José Luis,
Pregúntame por acá para que la respuesta le pueda servir a más personas. Con gusto te respondo todo lo que me preguntes.
@@MarcoDeRossi Buen día. Muchas gracias por contestar!!!. Tienes razón, la respuesta puede ser útil a más amigos. Soy usuario nuevo (1 semana) de 3DSlicer, me encanta el programa. Mi problema es el siguiente : seguí tu video instrucción a instrucción, pero al final no logro llegar al huesito limpio.
1.- En mi mente no queda claro (ya que no logro hacerlos funcionar bien juntos) como trabaja el comando Threshold, tampoco el comando isla , ya que no sé como elegir el intervalo para lograr evidenciar las densidades relativas y poder eliminar los elementos que no forman parte del hueso.
2.- No sé como definir para mi mismo el uso de la creación de segmen1, segment2, etc....
3.- como comentario, seguí al pie de la letra tus indicaciones para el setting de cada parámetro. El Spacing scale no sé ajustarlo a mis necesidades.
Si fuera posible, creo que nos ayudarías mucho a los novatos, definiendo el uso de las herramientas y en especial, detallando el tema de segmentación 13:23 en adelante.
Muchas gracias y espero me puedas ayudar con este tema, es muy apasionante...
@@JoseLuis-vf1hj El programa S3Dlicer es un programa muy complete y lleva tiempo entender como funciona, sigue practicando y viendo vídeos y empezara a tener más sentido todo.
Lo más importante es entender que la parte de segmentación depende mucho de la calidad de las imágenes médicas, muchos problemas de la segmentación suelen ser imágenes con poca resolución, artefactos metálicos o de movimiento o mucho ruido. Todo esto hace el proceso de segmentación mucho más difícil.
1. La palabra Threshold se podría traducir como RANGO, El comando Threshold sirve para segmentar (colorear) todos los voxels (píxel 3D) del volumen que están dentro de un rango de atenuación.
Por ejemplo, si usas el rango completo que te da la herramienta, entonces vas a segmentar todo el volumen, pero si vas moviendo los límites, podrás ir quitando atenuación que no te interesan hasta que solo segmentaras lo que está dentro de la atenuación que quieres.
Con esta herramienta puedes definir si quieres segmentar solo lo que es muy denso o poco denso, según lo que necesites.
Una isla es un grupo de Voxels que están unidos, la herramienta de isla permite borrar o dejar la isla seleccionada, además de otras opciones.
Esta es una herramienta muy importante pues te permite borrar todo lo que no quieres y dejar solo la isla que te interesa, o ir borrando islas que no quieres.
2. Cada segmentación es una capa de un color, y la puedes utilizar para
segmentar (colorear) algunos voxels (Es muy parecido a las capas en un programa de edición de imagen 2D como Photoshop)
Todo lo que esté en esa capa va a tener el mismo color, y puedes ir pintando lo que quieras dentro de esa capa.
Normalmente cada capa se utiliza para segmentar una estructura anatómica o tejidos distintos, así puedes tener orden en tu trabajo.
El principal problema que tiene 3DSLicer, es que por defecto, todo lo que dibujes en una capa, lo va a borrar de las otras capas donde se solape, esto lo tienes que deshabilitar en las opciones (allow overlap)
Para poder aprovechar al máximo el programa, es fundamental entender como usar las diversas segmentaciones como mascaras o guías para ir coloreando lo que te interesa, esto es probablemente lo más difícil de entender y de aprender, pero al mismo tiempo es la herramienta más potente del programa.
3. El spacing scale controla la resolución del nuevo volumen después de cortar todo lo que no nos interesa con la herramienta de CROP, el valor que vas a poner ahí va a dividir la resolución de las imágenes.
Es un poco confuso, porque funciona al contrario de lo que uno creería, es decir un número mayor baja la resolución, un numero menor la aumenta. Si pones 2, reducirá a la mitad la resolución, si pones 0.5, es como multiplicar por 2 la resolución.
No es buena idea aumentar mucho la resolución, puedes quedar con archivos muy pesados. 0.5 suele ser lo máximo que pongo para mejorar la resolución cuando he limitado mucho la zona del volumen sobre la que voy a trabajar.
Me gustaría poder hacer más vídeos, la verdad es que cuando tenga algo más de tiempo trataré de hacerlos. Explicar cada herramienta es un vídeo que he querido hacer desde hace tiempo y será el primero que haga.
Si tienes cualquier duda, escríbeme sin problema, pero te recomiendo que practiques un poco y vuelvas a ver el vídeo, en el explico muchas cosas que no se aprecian viéndolo una sola vez o si no entiendes muy bien los términos y las herramientas.
Buena suerte con el programa, es un campo muy complejo y muy amplio, requiere paciencia y práctica.