Akash Mitra
Akash Mitra
  • 79
  • 263 600
Codon search | #python | Bioinformatics | Looking for codons using basic python codes
Using basic Python codes including #pythonloops and #conditionals to search for codon position
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/
👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23
📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7
📸 akash_mitraa
🐤Twitter - akamitra20
🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz
Who am I -
I am a 2nd Year PhD student working in the field of Muscle Biology. Visit /akashmitraa.github.io/personal-website/ to know more about me.
If you would like to talk about the video or anything in general, just drop a word on Instagram or if you have a really long question then shoot me an email at akamitra20@gmail.com. I would surely respond 😃
#bioinformatics #genomics #coding
มุมมอง: 156

วีดีโอ

Loops in Python programming | while loop | for loop | step by step | for absolute beginners
มุมมอง 742 หลายเดือนก่อน
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸 akash_biologist 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz Who am I - I am a 2nd Year PhD student working in the field of Muscle...
R programming for biological data analysis | Plotting a bar graph with p-values | Part-4
มุมมอง 976 หลายเดือนก่อน
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz R programming for biological data analysis | Plotting a bar g...
R programming for biological data analysis | Performing statistical analysis | Part-3
มุมมอง 1456 หลายเดือนก่อน
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz R programming for biological data analysis | Performing stati...
R programming for biological data analysis | Importing dataset and cleaning the data | Part-2
มุมมอง 1146 หลายเดือนก่อน
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz R programming for biological data analysis | Importing datase...
R programming for biological data analysis | Setting up workspace and installing packages | Part-1
มุมมอง 1246 หลายเดือนก่อน
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz R programming for biological data analysis | Setting up works...
How to set Scale Bar using ImageJ software | Microscope | Imaging #howto #image
มุมมอง 18Kปีที่แล้ว
🔗Link for the reference image: Click on the first link on this website (akashmitraa.github.io/personal-website/) 🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist...
Vulva formation
มุมมอง 98ปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a...
Drawing a Phylogenetic Tree using PYTHON | Biopython tutorial | Bioinformatics
มุมมอง 3.4Kปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz Links to buy the book: 1. www.packtpub.com/product/bioinforma...
Pathfinder Academy book review | Life science books | Latest edition
มุมมอง 11Kปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz Pathfinder TH-cam channel - th-cam.com/users/PathfinderAcadem...
#metabolism | Conversion of Pyruvate to Acetyl CoA | PDH Complex | Biochemistry
มุมมอง 1.8Kปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz In this video, we take a deep dive in to the conversion proce...
#biopython #python | Sequence Alignment | Bioinformatics | Computational biology
มุมมอง 7Kปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz Here is how you can use biopython package for global and loca...
#ChitChat Episode#1 | A chat with Sumona Garg | AIR 74 | CSIR NET 2022 life science qualified
มุมมอง 7052 ปีที่แล้ว
🕸Website - akashmitraa.github.io/personal-website/ 👨🏻‍🎓My google scholar profile - shorturl.at/vKX23 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a1aa949c9bf77274224fe12a7 📸Instagram - akash_mitraa 🐤Twitter - akamitra20 🎵Study with me Playlist - open.spotify.com/playlist/6oN4dUzJJodHPy6acZsfqz 📚My ebook database - www.notion.so/Books-for-Biology-e6fe0b4a...
#Muscles | Anatomy of skeletal muscle | Musculoskeletal system | Physiology and Anatomy
มุมมอง 822 ปีที่แล้ว
#Muscles | Anatomy of skeletal muscle | Musculoskeletal system | Physiology and Anatomy
#Microbiology | Microbiological Culture Media | Microbiology | Types of media | PART 2
มุมมอง 682 ปีที่แล้ว
#Microbiology | Microbiological Culture Media | Microbiology | Types of media | PART 2
#Microbiology | Microbiological Culture Media | Microbiology | Types of media | PART 1
มุมมอง 1052 ปีที่แล้ว
#Microbiology | Microbiological Culture Media | Microbiology | Types of media | PART 1
#Allergy | Type 1 hypersensitivity | Allergic reaction mechanism | Immunology
มุมมอง 1102 ปีที่แล้ว
#Allergy | Type 1 hypersensitivity | Allergic reaction mechanism | Immunology
#Productivity | How to study better | The S.Q.A.T framework
มุมมอง 3952 ปีที่แล้ว
#Productivity | How to study better | The S.Q.A.T framework
#Biopython | How to get started | Bioinformatics | Computational biology
มุมมอง 26K2 ปีที่แล้ว
#Biopython | How to get started | Bioinformatics | Computational biology
#Biochemistry | Fluorescence Resonance Energy Transfer | FRET
มุมมอง 5712 ปีที่แล้ว
#Biochemistry | Fluorescence Resonance Energy Transfer | FRET
#Microbiology | How to calculate CFU/ml of bacterial solution | Viable Count Assay
มุมมอง 16K2 ปีที่แล้ว
#Microbiology | How to calculate CFU/ml of bacterial solution | Viable Count Assay
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 3
มุมมอง 812 ปีที่แล้ว
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 3
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 2
มุมมอง 502 ปีที่แล้ว
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 2
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 1
มุมมอง 1432 ปีที่แล้ว
#MolecularBiology | Lac operon | PART - 1
Proteasomal pathway | Protein degradation | Uniquitinylation | Biochemistry | Molecular biology
มุมมอง 6972 ปีที่แล้ว
Proteasomal pathway | Protein degradation | Uniquitinylation | Biochemistry | Molecular biology
Learning biology through story-telling and mnemonics | Remembering FACTS | Making it easy
มุมมอง 6022 ปีที่แล้ว
Learning biology through story-telling and mnemonics | Remembering FACTS | Making it easy
A day in the life | Study with me #2 | Vlog | CSIR NET life science aspirant | Akash Mitra
มุมมอง 8912 ปีที่แล้ว
A day in the life | Study with me #2 | Vlog | CSIR NET life science aspirant | Akash Mitra
Don't make notes, make QUESTIONS
มุมมอง 5172 ปีที่แล้ว
Don't make notes, make QUESTIONS
Types of Natural Selection | Evolution
มุมมอง 983 ปีที่แล้ว
Types of Natural Selection | Evolution
B cell maturation | Immunology | by Akash Mitra
มุมมอง 9K3 ปีที่แล้ว
B cell maturation | Immunology | by Akash Mitra

ความคิดเห็น

  • @vaishnav_ras_kirtan
    @vaishnav_ras_kirtan 22 ชั่วโมงที่ผ่านมา

    Hello sir, grate concept and i love to do biopython and your tutorial is very helpful to learn it . your website is not available, it shows 404 error.

  • @FredaSarkodie-tx2qk
    @FredaSarkodie-tx2qk 2 วันที่ผ่านมา

    Ha!! You just saved me 🎉❤ I love your class thanks for explaining this topic clearly to me

  • @AneeqaMunawar-ts6lg
    @AneeqaMunawar-ts6lg 5 วันที่ผ่านมา

    hi sir! kindly send me the reference image. I am greatly in need of it..

  • @thesunshine3804
    @thesunshine3804 7 วันที่ผ่านมา

    Thank you so much sir, your video really help me out🌼

  • @dewipuspita5917
    @dewipuspita5917 13 วันที่ผ่านมา

    can i have this image scale bar 1.000x ?

  • @justinxu9593
    @justinxu9593 23 วันที่ผ่านมา

    Thank you. Just wondering, why does this reference image work for any type of microscope?

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 21 วันที่ผ่านมา

      Because whichever microscope you use, 20x or 10x will be universal magnifications. The magnification of 20X in microscope 1 would be same as that of 20X in microscope 2. I hope this answers your question

  • @ITGIRL922
    @ITGIRL922 24 วันที่ผ่านมา

    after hours trying to find about imagej, finally. thank you for this video and the scale bar reference, sir. your audio is so clear, i can immediately understand what you say.

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 21 วันที่ผ่านมา

      Really appreciate that. Glad I could help

  • @IranianVibess
    @IranianVibess หลายเดือนก่อน

    Hello Can we use this reference image (all scales) for all of microscopic images including confocal microscope images?. Thank you

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology หลายเดือนก่อน

      Yes. You can use this for any microscopic images including confocal

  • @shehzadahmed426
    @shehzadahmed426 หลายเดือนก่อน

    Thank you so much sir

  • @user-yn3fk7vz7y
    @user-yn3fk7vz7y หลายเดือนก่อน

    Sir iam applying ap pgcet now I'm using this book for studying.

  • @user-ur2px7tb9j
    @user-ur2px7tb9j หลายเดือนก่อน

    Can I use replit?

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology หลายเดือนก่อน

      Yes you can. You have to install the dependencies on replit

    • @user-ur2px7tb9j
      @user-ur2px7tb9j หลายเดือนก่อน

      @@akashmitrabiology I got No such file or directory: 'tree dnd'. How to upload it on replit?

  • @jenicaashleypantollana6104
    @jenicaashleypantollana6104 หลายเดือนก่อน

    Hello! I've sent you an email regarding the reference image, sir. Hope that you could address this. Thank you!

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology หลายเดือนก่อน

      I think I emailed you back. Please let me know if I missed it

  • @maximopinela6957
    @maximopinela6957 2 หลายเดือนก่อน

    Muchas gracias por compartir tu conocimiento, saludos desde Ecuador.

  • @ayeeeppp
    @ayeeeppp 2 หลายเดือนก่อน

    Hi. If I have a protein dataset in fasta file and I wanted to filter them to fish out specific sequences that satisfies few characteristics, how should I do?

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology หลายเดือนก่อน

      Interesting question! I think it’s possible using conditionals. You can check out my codon search video. That might give you some idea. I will have a look as well. Thanks for the idea.

    • @ayeeeppp
      @ayeeeppp หลายเดือนก่อน

      @@akashmitrabiology Thanks. Using conditional helps!

  • @poorviasthana1587
    @poorviasthana1587 2 หลายเดือนก่อน

    after dragging the main image, i.e., fluorescent image into the imageJ , no dialogue box as such @7:45 appeared for me

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 2 หลายเดือนก่อน

      It will appear only if you set the scale bar at global in the previous step

    • @poorviasthana1587
      @poorviasthana1587 2 หลายเดือนก่อน

      @@akashmitrabiology Ya I had set up the scale bar at the prior step but still it is coming like that. Can you please also provide the method of how to count the number of live and dead cells in a image of Live/Dead assay, using ImageJ and that also of a specific RoI (Region of interest) ?

  • @ronalduscaesarianoekaputra6873
    @ronalduscaesarianoekaputra6873 2 หลายเดือนก่อน

    Dear Akash Mitra Sir, I have sent request email for image scale reference. Please kindly need your help. Thank yo Sir

  • @manjubabu27
    @manjubabu27 2 หลายเดือนก่อน

    Thanks for sharing the video. I've been struggling with this for a while, but your explanation really helped clear things up!

  • @user-us8tt3xg1w
    @user-us8tt3xg1w 2 หลายเดือนก่อน

    Do you have a scale reference for 2X?

  • @user-jr9tx9sy1m
    @user-jr9tx9sy1m 2 หลายเดือนก่อน

    Thank you for your kind assistance, sensei. However, I tried making use of the reference scale bar image but it is doubling the actual length of each line I measure.

  • @anishak.c.5442
    @anishak.c.5442 2 หลายเดือนก่อน

    Hello. I mailed you for the reference image. You haven't replied me. Please address this. I have my thesis defense next month.

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 2 หลายเดือนก่อน

      Hi. I have sent the image to you

  • @samirasedehi5262
    @samirasedehi5262 2 หลายเดือนก่อน

    Thank you for this video. I wish PyRx could offer students a special subscription rate for the software, similar to what PyMOL did.

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 2 หลายเดือนก่อน

      Is PyRx paid nowadays? I haven't used it in a long time though

  • @anythinganytime4645
    @anythinganytime4645 2 หลายเดือนก่อน

    Amazing explanation ❤

  • @easyhack5859
    @easyhack5859 3 หลายเดือนก่อน

    How we can know the level of magnification of pictures especially those pictures which are taken through high speed cameras ? Please someone guide me

  • @easyhack5859
    @easyhack5859 3 หลายเดือนก่อน

    What about those pictures which we take through camera so how can we know their magnification level ? Please guide

  • @khoinguyenlehoang6000
    @khoinguyenlehoang6000 3 หลายเดือนก่อน

    hello sir, how can i get your reference image ?

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 3 หลายเดือนก่อน

      Drop me an email at akamitra20@gmail.com

  • @kondwanizambwe2537
    @kondwanizambwe2537 3 หลายเดือนก่อน

    Omg thank you sir!!!!!!!

  • @dmadhav4867
    @dmadhav4867 3 หลายเดือนก่อน

    tqq bro , it helped me a lot for cell communication elective.

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 3 หลายเดือนก่อน

      Glad I could help. Please share the videos

    • @dmadhav4867
      @dmadhav4867 3 หลายเดือนก่อน

      @@akashmitrabiology yea sure

  • @bugisrantau77
    @bugisrantau77 3 หลายเดือนก่อน

    Big thanks brother, from Indonesia😊

  • @SagarSharma-up9zw
    @SagarSharma-up9zw 3 หลายเดือนก่อน

    awesome explaination

  • @Godswill247always
    @Godswill247always 3 หลายเดือนก่อน

    No, the middle one is 1/11. The total was supposed to be tenfold.

  • @shrinathmb
    @shrinathmb 3 หลายเดือนก่อน

    Hello sir , how to rorate the scale bar , which is horizontally place ?

  • @youareyourintentions1552
    @youareyourintentions1552 3 หลายเดือนก่อน

    Salams peace be on you It was really helpful:) Grateful to you.. Alhamdulillah ~8.2.2024 ~4:01 am

  • @rimpyhayer7638
    @rimpyhayer7638 3 หลายเดือนก่อน

    Thanks a ton. I have been struggling on this topic and you made it so easy.

  • @mr.sarfuddin3074
    @mr.sarfuddin3074 4 หลายเดือนก่อน

    Superb sir. It's awesome

  • @purushottampawar375
    @purushottampawar375 4 หลายเดือนก่อน

    I want to add a scale bar on microscopic images with 200X magnification. These images are scanned from the lab report, how can I add a scale bar to them

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 4 หลายเดือนก่อน

      You need to have a reference scale of 200X and you can follow this video. Unfortunately I don't have a reference scale of 200X

  • @ayushmegotia501
    @ayushmegotia501 4 หลายเดือนก่อน

    Sir,in my thesis i have to measure retinal vessels diameter,,,sir how i get scale bar for it

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 4 หลายเดือนก่อน

      In what magnification were the images taken?

  • @latifaghalamoun8398
    @latifaghalamoun8398 4 หลายเดือนก่อน

    Thank you sir 🤍

  • @fatemakaynat6634
    @fatemakaynat6634 4 หลายเดือนก่อน

  • @Regimented
    @Regimented 5 หลายเดือนก่อน

    Does one have to save a scale on every image. Even when you have many pictures

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 5 หลายเดือนก่อน

      Not necessary. You can show in one image on the panel and the rest you let it be

  • @gamitabhay3651
    @gamitabhay3651 5 หลายเดือนก่อน

    When 8th edition of pathfinder life science comes?

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 5 หลายเดือนก่อน

      No idea. You can call them up and ask

  • @shabbirsain7470
    @shabbirsain7470 5 หลายเดือนก่อน

    Dear sir I am not able to understand! Why did u change 75 um to 100 um at 20x magnification. Kindly if u got my msg plz help me to sort out

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 5 หลายเดือนก่อน

      We are not changing the magnification. We are just changing the length of the scale bar. You can set it to whatever you want once you have the measurements down for any magnification.

  • @abugomana2648
    @abugomana2648 6 หลายเดือนก่อน

    how to draw a square out of a specific area of a picture i want to magnify? thnk you

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 6 หลายเดือนก่อน

      Use the square tool and crop it using cmd+shift+X

  • @elifbasgclar8957
    @elifbasgclar8957 6 หลายเดือนก่อน

    What should we do if we want to add a gap penalty that distinguishes between open penalty and extended penalty values?

  • @umamohan9989
    @umamohan9989 6 หลายเดือนก่อน

    Where can i get the dataset

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 6 หลายเดือนก่อน

      Give me some time. I will make it available as a github repo

  • @girishrenganathan5877
    @girishrenganathan5877 6 หลายเดือนก่อน

    What version of python should I install for the biopython

  • @srimathiramesh5799
    @srimathiramesh5799 6 หลายเดือนก่อน

    Hello! Could you please share the link to the reference image. I have already mailed you.

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 6 หลายเดือนก่อน

      I think I had replied to your email

  • @vitalykozin7088
    @vitalykozin7088 6 หลายเดือนก่อน

    Nematode’s sperm is ameboid, it lucks flagellum!

  • @vipi9463
    @vipi9463 7 หลายเดือนก่อน

    Plz plz plzz answer sir....is it hectic???like after msc in microbiology...is the job hectic??

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 6 หลายเดือนก่อน

      I m not the right person to say about this as I have myself shifted from microbiology

  • @mirzasaki6429
    @mirzasaki6429 7 หลายเดือนก่อน

    Can't be more greatful. This is the perfect explanation of B cell maturation. Thanks a ton. Keep going. ❤

  • @ahmedomarmakram6136
    @ahmedomarmakram6136 7 หลายเดือนก่อน

    very boring video

    • @akashmitrabiology
      @akashmitrabiology 7 หลายเดือนก่อน

      Hey dude. Thanks for the comment. Will try to do better 😊

    • @ahmedomarmakram6136
      @ahmedomarmakram6136 7 หลายเดือนก่อน

      @@akashmitrabiology I am sorry my ideiot brother who wrote this comment because he dont love science. by the way the video was very perfect

    • @ahmedomarmakram6136
      @ahmedomarmakram6136 7 หลายเดือนก่อน

      @akashmitrabiology I am sorry my ideiot brother who wrote this comment because he dont love science. by the way the video was very perfect