Constructing Whittaker rank-abundance curves using BiodiversityR

Segundo tutorial para la elaboración de curvas de rango de abundancia de especies o curvas de dominancia de Whittaker para la descripción de la composición de las comunidades de especies en uno o más sitios utilizando el programa BiodivesityR.
Para instalar el programa Biodiversity R, se puede usar el siguiente script:
#see the manual: Installation of BiodiversityR: instructions for Windows users
install.packages(pkgs=c("BiodiversityR","vegan", "Rcmdr", "mgcv","cluster", "RODBC", "rpart", "effects", "multcomp","ellipse", "maptree", "sp", "splancs", "spatial","akima", "nnet", "dismo", "raster", "rgdal", "bootstrap", "PresenceAbsence","maxlike", "gbm", "randomForest", "gam", "earth", "mda","kernlab", "e1071", "glmnet", "sem", "rgl", "relimp","lmtest", "leaps", "Hmisc", "colorspace", "aplpack","abind", "XLConnect", "car", "markdown", "knitr","geosphere", "maptools", "rgeos", "ENMeval", "red"),dependencies=c("Depends", "Imports"))
library(BiodiversityR) #use BiodiversityRGUI() if you want to work with the program interface
La base de datos 'seeds' y los scripts completos están disponibles en el siguiente link de OneDrive:
6f33fa7f78ea46...
Para mayores detalles sobre el tema y el curso pueden contactar a: Óscar M. Chaves ([e-mail])

[@ianpaulmedinatorres9750]

Hola, llevaba un tiempo en ver la forma de cómo desarrollar este gráfico de Whittaker o rango-abundancia (también lo he encontrado como riqueza-abundancia, diversidad-dominancia y otras variaciones con el nombre) en R, hasta la fecha lo realizaba en Excel similar a la última forma que muestras, teniendo las muestras o localidades por separados la línea de distribución de las abundancias de las especies, lo que encontraba en R solo era el gráfico iniciando desde un mismo punto, donde las líneas de dispersión se solapaban y no se ve tan estético, a mi modo de ver, mejor presentación tiene teniendo las líneas de dispersión separadas una de la otra, y ahora que ud. nos trae este ejemplo, creo que ya no lo haré en Excel, sino en R..muchas gracias por este gran aporte y también por compartir los recursos. Saludos desde Perú

[@JKitora]

Hola, puedes enseñar mas sobre r y los diferentes indices de biodiversityr? :'^ es de gran ayuda, al igual como organizar los datos en tablas de Excel para que rstudio los lea

[@cristhianandresloorbriones5844]

muy buen video, pero no me pudo correr la gráfica, me sale este erro; in `plot_theme()`:
! Problem merging the `line` theme element
Caused by error in `merge_element()`:
! No method for merging into
Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

[@santiagoestebantrujillojim5361]

Mil gracias por el video pero presento un problema con el comando del min 15:53, al parecer esta mal en el escrito o ya no se puede usar. No se si hay algún comando alterno.

[@kristhiepillacarodriguez5396]

tengo el mismo problema, no me corre

[@irvinggomez7816]

debes cargar el package BiodiversityR..y listo@@kristhiepillacarodriguez5396