Un gran saludo. Por favor seria muy interesante que hiciera un video que describa cual es el procedimiento para subir un genoma bacteriano a NCBI. El tipo de archivos que se requieren para incluir las secuencias, de acuerdo a la informacion que se tenga, si el genoma solo esta ensamblado o con anotaciones. Gracias
Hola! Excelente video, queda bastante claro y resumido. Tengo una consulta ¿Cómo realizo el análisis estadístico? El script se corre bajo python u algún software en específico (?)
Hola Joel. Gracias por el interes y el comentario. Toda la gráfica y estadísticas la hago en R. Me sirve de inspiración el R Gallery. Si te gusta más python, puedes hacer las mismas gráficas y analisis con librerías cómo matplotlib o numpy.
Excelente explicación, muchas gracias!! solo tengo una duda, instale sratoolkit en biolinux en una vbox, cuando intento ejecutar el comando prefetch me indica que el comando (zsh: command not found: prefetch), pero reviso y esta instalado, y comandos como fastq-dump si funcionan, alguna idea de que puedo estar haciendo mal?
Muchas gracias por compartirnos su conocimiento y estos fabulosos videos. Realmente son de gran ayuda.!!
Dios, que buen video. Muchas gracias por darte el tiempo de explicarnos. Excelente !!!!!
Gracias Francisco! Me hace muy feliz que te sea util.
¡Qué buen canal! Me suscribo. Gracias por la información.
Fabuloso, gracias por el video
Excelente video!
Excelente Profesor Alzate, todo muy bien explicado.
Muy buena informacion, Gracias
Sumamente interesante
Muy bueno!
Un gran saludo. Por favor seria muy interesante que hiciera un video que describa cual es el procedimiento para subir un genoma bacteriano a NCBI. El tipo de archivos que se requieren para incluir las secuencias, de acuerdo a la informacion que se tenga, si el genoma solo esta ensamblado o con anotaciones. Gracias
Muy buena idea. Lo pondré en la lista para próximos temas. Gracias!
¡Está muy interesante el video!
Me emocioné y empecé a seguirle el paso, pero no tengo lumix :c
Hola....por si acaso haz instalado y manejado SIGNAL? tengo unos inconvenientes en su corrida
Hola Tanya. Nada, no lo he usado.
Muy buen video estimado profesor. Emplea algùn servidor especifico para hacer el esamblaje?
Gracias
Yo instalo localmente los ensambladores. Creo que así es más fácil
@@genomicafacil8501 muchas gracias
Hola! Excelente video, queda bastante claro y resumido.
Tengo una consulta ¿Cómo realizo el análisis estadístico? El script se corre bajo python u algún software en específico (?)
Hola Joel. Gracias por el interes y el comentario. Toda la gráfica y estadísticas la hago en R. Me sirve de inspiración el R Gallery. Si te gusta más python, puedes hacer las mismas gráficas y analisis con librerías cómo matplotlib o numpy.
@@genomicafacil8501 ¡Muchas gracias!
Excelente explicación, muchas gracias!! solo tengo una duda, instale sratoolkit en biolinux en una vbox, cuando intento ejecutar el comando prefetch me indica que el comando (zsh: command not found: prefetch), pero reviso y esta instalado, y comandos como fastq-dump si funcionan, alguna idea de que puedo estar haciendo mal?
Hola Elizabeth. No tengo experiencia con Vbox pero creo que debes dar la ruta absoluta a la carpeta con el programa prefetch