Nanopore MinION starter-pack video

แชร์
ฝัง
  • เผยแพร่เมื่อ 29 เม.ย. 2019
  • This video shows how to prepare a rapid library (based on starter pack) and run it on MinION apparatus
    prepared in Dr. Matan Oren Lab at Ariel University by Svetlana Maslov and David Bern

ความคิดเห็น • 25

  • @asvenesharma8777
    @asvenesharma8777 4 ปีที่แล้ว +4

    Very well demonstrated.. keep it up..

  • @bockwurstesser1046
    @bockwurstesser1046 ปีที่แล้ว

    8:11 "gently open the Spot ON cover, to expose the loading airport" lol.
    Keep up the good work👍🏾

  • @bijigd8957
    @bijigd8957 3 ปีที่แล้ว +1

    Thanks. very useful

  • @davidbogler4565
    @davidbogler4565 ปีที่แล้ว

    Nice video. Is this done using only the ligation kit reagents in the startup package? What kind of DNA are you sequencing (PCR product)?

  • @easywang2257
    @easywang2257 3 ปีที่แล้ว +1

    Thank you for your detailed explanation
    According to your experience, if you perform a whole transcriptome experiment on mouse cells and add 12 barcodes, can a flow cell measure the differential expression data of the whole transcriptome?
    Thank you so much!

  • @anweshag91
    @anweshag91 2 ปีที่แล้ว +1

    Hi. Thank you for the detailed video. If I want to get 0.5GB data per sample, how many samples can I combine and load in one flow cell?

  • @magiclee9482
    @magiclee9482 4 ปีที่แล้ว +2

    Thank you for the video tutorial! Do you have everything written down?

    • @matanoren2220
      @matanoren2220  3 ปีที่แล้ว +1

      All protocols are available in ONT community

    • @wardaamjad8311
      @wardaamjad8311 2 ปีที่แล้ว

      @@matanoren2220 dear sir, what is ont community? From where we can find?

    • @ichrafhammami797
      @ichrafhammami797 2 หลายเดือนก่อน

      ​@@wardaamjad8311nanopore Oxford technology

  • @fatimakhalid7446
    @fatimakhalid7446 ปีที่แล้ว

    Very nice vdo.

  • @GraceBeyondRace
    @GraceBeyondRace 4 ปีที่แล้ว +1

    Pls upload new video regarding this tech if possible.

  • @MrHassan213
    @MrHassan213 หลายเดือนก่อน

    its possible send the steps protocol?

  • @shivanikhataokar210
    @shivanikhataokar210 ปีที่แล้ว

    What amount of FLT did you guys put in the sample?

  • @dr.whocares8702
    @dr.whocares8702 ปีที่แล้ว

    One question, is the pcr really necessary? I was told it could be done without it.

    • @mookfaru835
      @mookfaru835 หลายเดือนก่อน

      They are probably maximizing thier return

  • @SofiasBio
    @SofiasBio 8 หลายเดือนก่อน

    What kind of flow cell is this?

  • @arctic618
    @arctic618 4 ปีที่แล้ว +1

    i wonder myself if this is anonymous , do you need to be connected on internet to run it ? I v heard that informations comunicate on theirs servers.

    • @matanoren2220
      @matanoren2220  3 ปีที่แล้ว +2

      It is anonymous and it can be run without internet (other then updates )

  • @Selahmescudi
    @Selahmescudi 2 ปีที่แล้ว

    is this machine able to sequence a whole human genome?

  • @sonyxperiasmk
    @sonyxperiasmk 3 ปีที่แล้ว +1

    How many Times can you use a flow cell?

    • @thoughtworn
      @thoughtworn 3 ปีที่แล้ว

      Just once. But you can multiplex samples through barcoding

    • @matanoren2220
      @matanoren2220  3 ปีที่แล้ว +7

      Potentially several times until performance is going down. You can check the available pores before each run

  • @JohnnyMnemonic882
    @JohnnyMnemonic882 3 ปีที่แล้ว

    Does it offer the code in full form of all DNA? Some chromosome? Or the sequence of some gene?

    • @matanoren2220
      @matanoren2220  3 ปีที่แล้ว

      Depending what you sequence. This is the rapid protocol, so it will sequence parts of the target sequence (either a genome or a PCR product)