Muchas gracias, muy buena guía. Sugeriría para un próximo tutorial, una visualización de cómo se organizan los datos dentro del archivo CSV para su correcta lectura por maxent.
Tengo una pregunta, yo tengo datos de muchas especies con abundancia y en mi estudio la abundancia es muy importante, no sólo la presencia. MaxEnt trabaja con abundancias? Por ejemplo una de mis especies es muy abundante en el bosque húmedo tropical donde colecté mas de 500 especímenes en una sola trampa, pero muy rara en bosque seco donde encontré un individuo nada más entonces presencia ausencia no me serviría y como las muestras son atrapadas con trampa las 500 pertenecen a una misma coordenada. Puedo incluir datos de abundancia de alguna manera en maxent?
Hola tengo una pregunta al momento de modelar con maxent me aparece este aviso (Different geographic dimensions) y me nombrar las variable que presenta este probloma. ¿Como puedo solucionar esto? gracias :)
Hola, tengo puntos de muestreo de una especie, cada punto corresponde a una cámara trampa donde algunas tuvieron mayor numero de captura o presencia de la especie que otras cámaras . Se puede modelar los puntos con algún atributo que especifique que ese punto tiene mas presencia que otro punto?
Hola, tengo una pregunta. Tengo los archivos en todos los formatos que dices, pero me saca un error respecto a las coordenadas, que están fuera del rango de las condiciones ambientales que yo introduje. Pero esto yo lo he corregido varias veces verificando que las coordenadas coincidan con lo que yo quiero. Pero sigue apareciendo. A qué se debe este error??. ¿Los archivos de condiciones ambientales qué especificaciones deben de tener??. Deben estar orto-rectificadas o si las descargo directamente de WORLDCLIM estarán georreferenciadas?. Soy nuevo en esto muchas gracias
Hola, muchas gracias por el video, tengo una duda. Cuento con los datos de distribución, pero adicional cuento con datos de densidad poblacional. Hay alguna forma de incluir estos datos en maxent para poder generar una predicción más exacta? Tienes algun programa en mente para predecir la distribución en plagas?
Hola, me gusta mucho su video, ahora con la nueva versión ArcGis Pro cambiaron las cosas. Podrían recomendarme un video donde pueda utilizar los resultados de maxent en ArcGis Pro? Muchas gracias
Hola! espero me puedan ayudar, y disculpen la falta de acentos, mi teclado esta en ingles. Como le hago para que maxent reconozca archivos que he obtenido de una pagina llamada worldclim? esta me ofrece datos genericos (generic grids) que se bajan en una carpeta zip, y que al extraerlos quedan con extension .hdr; al tratar de incorporarlos a maxent como layers no se expresan en la pantalla para poder hacer uso de las mismas. Debo de convertirlos antes de hdr a asci? en caso de que asi sea, como hago eso?
Hola , al momento de convertir el archivo .asc* a raster , no sube los datos cómo están en maxent aparece de manera monocromática , sin información . Espero puedas ayudarme , gracias
Hola.. sabes porque no puedo visualizar los archivos ambientales en maxent,??..en lo particular descargue las variables bioclimáticas de Wordclim.. después en arcgis, las corte para mi área de interes y luego convertí el raster a ascii.. y cuando trato de abrirlos en Maxent, no me aparece nada..
Hola Samuel. Pégale un vistazo a este curso: geoinnova.org/cursos/curso-sig-maxent-y-arcgis-modelos-predictivos-de-distribucion-de-especies-nichos-ecologicos-y-conectividad-mediante-tecnologias-sig/
Muy interesante el video, gracias por compartirlo. Tengo una pregunta, cómo puedo obtener un archivo ASCII a partir de arcivos en formato raster, lo intento por las opciones del arctoolbox/Conversion tools/Raster to ASCII y al momento de ingresarlos a MAXENT solo tengo formatos .prj t .txt, que debo hacer?
Disculpa podrías ayudarme con Maxent. Al subir el archivo de distribución en formato csv, me sale error "extra fields". Sabes cómo puedo solucionarlo, y conoces alguna página donde haya datos de distribución mundial de las especies?
hola, alguna recomendacion para descargar shapes de altitud, temperatura y precipitación de brasil? de paginas confiables? ya busqué en varias pero al pasar el archivo a (asc ) no me deja correr el modelo. Saludos y gracias por el video
Hola, tienes algunos sitios buenos que puedes sacar las informaciones. La altitude y precipitación puedes ir al sitio "topodata": www.dsr.inpe.br/topodata/. La temperatura nosotros descargamos del WorldClim.
Hola muy buen tutorial, pero tengo un problema: Estoy intentando convertir archivos de raster a ascii por ArcGis, para trabajarlos en Maxent, pero los archivos que me genera son extremadamente grandes 100 MB y no pueden ser procesados por Maxent, como puedo generar archivos en ascii, mas pequeños?
Eso se debe al tamaño de la celda que utilizas, entre mas chicas son las celdas mas grande va a pesar el archivo porque es mayor cantidad de información, prueba trabajando con celdas mas grandes.
Alguien qu me pueda indicar los requerimientos de los rasters para soportarlos el programa. Al correr el modelo me aparece un error diciendo tiene diferentes dimensiones geográficas. Les comento que tengo los raster en *.tiff y con ArcGIS los exporte a un archivo *.asc. Alguien que me pueda colaborar, muchas gracias.
Está interesante el video, sin embargo, tengo algunas dudas... 1.- Que variables fueron las que más varianza explicaron?? 2.- De donde obtuvieron los datos de background??? 3.- Si no estás utilizando capas con las proyección de las variables, como sabes que esas proyecciones son correctas?? Saludos y ojalá me pueda aclarar las dudas...
Daniel Drk El modelo maxent es un modelo predictivo sobre la distribuccion de especie, 1.- tiene una base parecida a modelo de regresion logistica, con variables dependientes e independientes, las variables dependientes se ajustan ala respuesta de la variables independientes, puedes poner las variables consideradas para la especie 2-. las variables bioclimaticas tienen una fuerte relacion con las especies estas la puedes descargar www.worldclim.org/current a nivel mundial con diferentes resoluciones. solo que bienen en formato .bil solo hy que convertir a ASCII 3.- para trabajar, las variables y los pts de presencia deben tener coordenadas decimales. Saludos
Juan Silva Pero si prestas atención el no uso un modelo logístico, uso uno acumulativo. Si las variables ambientales son importantes, pero el nicho ecológico de la especie no esta determinado solo por las variables ambientales que le gustan, y tampoco todas las variables tienen la misma importancia. A mí me quedan muchas dudas, que tan sobreajustado esta su modelo, cual es el porcentaje de omisión y comisión, cuantas repeticiones realizo, uso datos de prueba, que porcentaje umbral usa para determinar presencia o ausencia, ha que probabilidad se refiere maxent ?
TheVladtepesIII mencione que era parecida en base al utilizar variables dependientes (muestreo de presencia o ausencia) y las variables independientes(variables que se sepan que inciden en la ecologia de la especie en cuestion) Para modelar las distribuciones se basa en el principio de Máxima entropía. usa iteraciones en lo cual va dando distintos pesos alas variables utilizadas y va ajustándolas, Maxent presenta una curva de omisión de datos de prueba (25 % de puntos aleatorios) contra omisión de datos de entrenamiento mediante una matriz de error o confusion y el umbral fijo que refute sólo el 10% más bajo de los posibles valores predichos
Muchas gracias, muy buena guía. Sugeriría para un próximo tutorial, una visualización de cómo se organizan los datos dentro del archivo CSV para su correcta lectura por maxent.
Congratulations, your explanation is short, straight to the point and very clear for understanding the potential for using maxent !!
#Maxent es una herramienta a tener en cuenta a la hora de crear modelos predictivos de distribución de especies con #SIG
Y para realizar un análisis de cambio de cambio de uso del suelo que variables podría utilizar...?? Gracias y sin duda un excelente vídeo.
Muchas gracias, buen video. Tengo una consulta, ¿cómo convertiste las variables raster a asc?
eso se puede hacer con una herramienta de ArcGIS creo que se llama "Raster to ascii"
Tengo una pregunta, yo tengo datos de muchas especies con abundancia y en mi estudio la abundancia es muy importante, no sólo la presencia. MaxEnt trabaja con abundancias? Por ejemplo una de mis especies es muy abundante en el bosque húmedo tropical donde colecté mas de 500 especímenes en una sola trampa, pero muy rara en bosque seco donde encontré un individuo nada más entonces presencia ausencia no me serviría y como las muestras son atrapadas con trampa las 500 pertenecen a una misma coordenada. Puedo incluir datos de abundancia de alguna manera en maxent?
Hola tengo una pregunta al momento de modelar con maxent me aparece este aviso (Different geographic dimensions) y me nombrar las variable que presenta este probloma. ¿Como puedo solucionar esto? gracias :)
Hola, tengo puntos de muestreo de una especie, cada punto corresponde a una cámara trampa donde algunas tuvieron mayor numero de captura o presencia de la especie que otras cámaras . Se puede modelar los puntos con algún atributo que especifique que ese punto tiene mas presencia que otro punto?
en donde encuentro las capas de las variables climáticas
Hola, tengo una pregunta. Tengo los archivos en todos los formatos que dices, pero me saca un error respecto a las coordenadas, que están fuera del rango de las condiciones ambientales que yo introduje. Pero esto yo lo he corregido varias veces verificando que las coordenadas coincidan con lo que yo quiero. Pero sigue apareciendo. A qué se debe este error??. ¿Los archivos de condiciones ambientales qué especificaciones deben de tener??. Deben estar orto-rectificadas o si las descargo directamente de WORLDCLIM estarán georreferenciadas?. Soy nuevo en esto muchas gracias
Hola, muchas gracias por el video, tengo una duda. Cuento con los datos de distribución, pero adicional cuento con datos de densidad poblacional. Hay alguna forma de incluir estos datos en maxent para poder generar una predicción más exacta? Tienes algun programa en mente para predecir la distribución en plagas?
Hola, me gusta mucho su video, ahora con la nueva versión ArcGis Pro cambiaron las cosas. Podrían recomendarme un video donde pueda utilizar los resultados de maxent en ArcGis Pro? Muchas gracias
Hola! espero me puedan ayudar, y disculpen la falta de acentos, mi teclado esta en ingles. Como le hago para que maxent reconozca archivos que he obtenido de una pagina llamada worldclim? esta me ofrece datos genericos (generic grids) que se bajan en una carpeta zip, y que al extraerlos quedan con extension .hdr; al tratar de incorporarlos a maxent como layers no se expresan en la pantalla para poder hacer uso de las mismas. Debo de convertirlos antes de hdr a asci? en caso de que asi sea, como hago eso?
Hola , al momento de convertir el archivo .asc* a raster , no sube los datos cómo están en maxent aparece de manera monocromática , sin información . Espero puedas ayudarme , gracias
hola, tengo el mismo problema, lo solucionaste?
Aún no puedo solucionarlo
Hola.. sabes porque no puedo visualizar los archivos ambientales en maxent,??..en lo particular descargue las variables bioclimáticas de Wordclim.. después en arcgis, las corte para mi área de interes y luego convertí el raster a ascii.. y cuando trato de abrirlos en Maxent, no me aparece nada..
Hola Samuel. Pégale un vistazo a este curso: geoinnova.org/cursos/curso-sig-maxent-y-arcgis-modelos-predictivos-de-distribucion-de-especies-nichos-ecologicos-y-conectividad-mediante-tecnologias-sig/
Muy interesante el video, gracias por compartirlo. Tengo una pregunta, cómo puedo obtener un archivo ASCII a partir de arcivos en formato raster, lo intento por las opciones del arctoolbox/Conversion tools/Raster to ASCII y al momento de ingresarlos a MAXENT solo tengo formatos .prj t .txt, que debo hacer?
+Roman Felipe Diaz Ayala amigo resolviste tu duda? to tenia el mismo problema y lo resolví sustituyendo el .txt por .asc, suerte!
+Jorge Garcia No me funciono... :S otra opción para hacerlo?
+Jorge Garcia Buenas tardes, Disculpe ¿podría por favor decirme qué hago sino me aparece la opción de pasar a .asc?
+Danny_Ta Corrales Ballen A mi me resultó únicamente sustituyendo la extensión .txt por la extensión .asc
Disculpa podrías ayudarme con Maxent. Al subir el archivo de distribución en formato csv, me sale error "extra fields". Sabes cómo puedo solucionarlo, y conoces alguna página donde haya datos de distribución mundial de las especies?
hola, alguna recomendacion para descargar shapes de altitud, temperatura y precipitación de brasil? de paginas confiables? ya busqué en varias pero al pasar el archivo a (asc ) no me deja correr el modelo. Saludos y gracias por el video
Hola, tienes algunos sitios buenos que puedes sacar las informaciones. La altitude y precipitación puedes ir al sitio "topodata": www.dsr.inpe.br/topodata/. La temperatura nosotros descargamos del WorldClim.
Hola muy buen tutorial, pero tengo un problema: Estoy intentando convertir archivos de raster a ascii por ArcGis, para trabajarlos en Maxent, pero los archivos que me genera son extremadamente grandes 100 MB y no pueden ser procesados por Maxent, como puedo generar archivos en ascii, mas pequeños?
Eso se debe al tamaño de la celda que utilizas, entre mas chicas son las celdas mas grande va a pesar el archivo porque es mayor cantidad de información, prueba trabajando con celdas mas grandes.
Hola, alguien sabe como hacer esas ediciones en la simbología (la barra de colores en horizontal) en arcmap 10.3?
Alguien qu me pueda indicar los requerimientos de los rasters para soportarlos el programa. Al correr el modelo me aparece un error diciendo tiene diferentes dimensiones geográficas. Les comento que tengo los raster en *.tiff y con ArcGIS los exporte a un archivo *.asc. Alguien que me pueda colaborar, muchas gracias.
Hola.. ¿Puede decirme cómo hacer 10 valores de percentiles
thanks a lot
Hay que siempre considerar que es un entrenamiento de modelo, el modelo de Maxima entropía en si!, no es el que realiza el modelo, esto por el coste!!
los datos de precipitacion , altura y temperatura q son raster.
Está interesante el video, sin embargo, tengo algunas dudas... 1.- Que variables fueron las que más varianza explicaron?? 2.- De donde obtuvieron los datos de background??? 3.- Si no estás utilizando capas con las proyección de las variables, como sabes que esas proyecciones son correctas?? Saludos y ojalá me pueda aclarar las dudas...
Daniel Drk El modelo maxent es un modelo predictivo sobre la distribuccion de especie, 1.- tiene una base parecida a modelo de regresion logistica, con variables dependientes e independientes, las variables dependientes se ajustan ala respuesta de la variables independientes, puedes poner las variables consideradas para la especie 2-. las variables bioclimaticas tienen una fuerte relacion con las especies estas la puedes descargar www.worldclim.org/current a nivel mundial con diferentes resoluciones. solo que bienen en formato .bil solo hy que convertir a ASCII 3.- para trabajar, las variables y los pts de presencia deben tener coordenadas decimales.
Saludos
Juan Silva Pero si prestas atención el no uso un modelo logístico, uso uno acumulativo. Si las variables ambientales son importantes, pero el nicho ecológico de la especie no esta determinado solo por las variables ambientales que le gustan, y tampoco todas las variables tienen la misma importancia. A mí me quedan muchas dudas, que tan sobreajustado esta su modelo, cual es el porcentaje de omisión y comisión, cuantas repeticiones realizo, uso datos de prueba, que porcentaje umbral usa para determinar presencia o ausencia, ha que probabilidad se refiere maxent ?
TheVladtepesIII mencione que era parecida en base al utilizar variables dependientes (muestreo de presencia o ausencia) y las variables independientes(variables que se sepan que inciden en la ecologia de la especie en cuestion) Para modelar las distribuciones se basa en el principio de Máxima entropía. usa iteraciones en lo cual va dando distintos pesos alas variables utilizadas y va ajustándolas, Maxent presenta una curva de omisión de datos de prueba (25 % de puntos aleatorios) contra omisión de datos de entrenamiento mediante una matriz de error o confusion y el umbral fijo que refute sólo el 10% más bajo de los posibles valores predichos