Михаил Гельфанд - Типичные задачи биоинформатики

แชร์
ฝัง
  • เผยแพร่เมื่อ 23 พ.ย. 2024

ความคิดเห็น • 11

  • @ukrainetoday960
    @ukrainetoday960 2 หลายเดือนก่อน

    35:27 нейронные сетки пишут на Питоне - на либах pyTorch и TensorFlow

  • @mikhailmyshkin4615
    @mikhailmyshkin4615 2 หลายเดือนก่อน

    Работаю в биоинформатике и пользуюсь смесью R+Python, причем Python основной. На питоне гораздо удобнее писать всякие склейки, пайплайны, чуть более вычислительно сложные скрипты. А R идеален для графиков, верчения таблиц и статистики. Берём лучшее из них обоих, ну и конечно же весь код - в Jupyter notebook

  • @major807
    @major807 2 หลายเดือนก่อน

    Лайк Михаилу Сергеевичу

  • @dmitriyskvortsov9650
    @dmitriyskvortsov9650 2 หลายเดือนก่อน +1

    Тоже работаю в области , за всю жизнь изучил не менее двух десятков языков, и не один из них не производил такого глубокого чувства отторжения как питон, на мой взгляд язык питон был создан совершенно напрасно, он ни чем не выделяется из языков созданных за десятилетия до него. На мой вкус на этом языке одинаково неудобно делать практически все

    • @ukrainetoday960
      @ukrainetoday960 2 หลายเดือนก่อน

      Пишите на ассемблере, в чем проблема-то?

    • @AsanEmirsaleh
      @AsanEmirsaleh 2 หลายเดือนก่อน

      Всё-таки некоторыми особенностями выделяется. Но если Вам не нравится питон - пишите на Julia. Похоже на питон, но лучше продумано. У Heng Li в коде minimap2 вообще часть инструментов (например, paftools) написаны на javascript. Системные биологи любят Java, решения для обработки данных высокопроизводительного секвенирования часто пишут на плюсах. То, что фундаментальное программирование лучше изучать не с питона - это, наверное, оправданное мнение, но применительно к тому случаю, когда вы хотите получить на выходе программиста. А если нужен преимущественно скриптинг, то питон или bash вполне подойдут.

  • @Tosha.V
    @Tosha.V 2 หลายเดือนก่อน

    Ошибка на слайдах 08:38 не Депозиторий а Репозиторий, хотя биологам простительно)

    • @pupsique
      @pupsique 2 หลายเดือนก่อน

      Депозитарий правильно.

    • @Tosha.V
      @Tosha.V 2 หลายเดือนก่อน

      ​​@@pupsique то же думал про депозитарий, но не та буква в конце смутила)

    • @AsanEmirsaleh
      @AsanEmirsaleh 2 หลายเดือนก่อน

      Депозитарий живых объектов - вполне устоявшийся термин. Репозитарий/репозиторий кода - тоже старый хорошо известный термин. Насчёт "а"/"о" в этом слове - вопрос нуждается в изучении. Подозреваю, что слова однокоренные, и в оригинале пишутся одинаково.