Lucy zhang
Lucy zhang
  • 28
  • 42 893

วีดีโอ

how to solve duplicated row names when read in table in R language
มุมมอง 132ปีที่แล้ว
how to solve duplicated row names when read in table in R language
功能预测的一些可视化定制分享 1--picrust2之后可以绘制哪些图-示例分享
มุมมอง 273ปีที่แล้ว
example figure after picrust2 or other function prediciton
tip 1 for course students--conflicts found when loading R packages is OK
มุมมอง 199ปีที่แล้ว
for fresh learner in R
qiime2 安装失败怎么办-qiime2之后可以做哪些分析
มุมมอง 100ปีที่แล้ว
qiime2 安装失败怎么办-qiime2之后可以做哪些分析
R language-how to solve error ---- could not find function
มุมมอง 672ปีที่แล้ว
R language-how to solve error could not find function
Use adobe illustrator to create legend for gephi or use R to generate legend
มุมมอง 472ปีที่แล้ว
Use adobe illustrator to create legend for gephi or use R to generate legend
basic pc requirement for qiime2--16g ram and 10 g storage in C
มุมมอง 78ปีที่แล้ว
basic pc requirement for qiime2 16g ram and 10 g storage in C
gephi tutorial1--after 39.simple_network.r-network visualization by gephi
มุมมอง 2.9K2 ปีที่แล้ว
network visualization by gephi
how to run R code in R studio? Before you start hour course, small things you need to know~
มุมมอง 4.6K2 ปีที่แล้ว
how to run R code in R studio? Before you start hour course, small things you need to know~
before start our R course, please install R, Rstudio and R tools and R packages first~
มุมมอง 6032 ปีที่แล้ว
how to install R and R studio and rtools and R packages
gephi tutorial gephi教程 gephi 0.9.4版本测试 区别不大 gephi中文界面教程补充~最佳网络图可视化软件之一
มุมมอง 1.1K2 ปีที่แล้ว
gephi tutorial gephi教程 gephi 0.9.4版本测试 区别不大 gephi中文界面教程补充~最佳网络图可视化软件之一
Input data format for R pipeline for qiime2
มุมมอง 1.5K2 ปีที่แล้ว
33 course, 59 scripts, each code less than 10$;
R pipeline after qiime2 on microbial data analysis
มุมมอง 9K2 ปีที่แล้ว
R pipeline after qiime2 on microbial data analysis
微生物数据分析必修课宣传片--introduction of microbial data analysis course
มุมมอง 1772 ปีที่แล้ว
微生物数据分析必修课宣传片 introduction of microbial data analysis course
pcoa result visualization by R
มุมมอง 5753 ปีที่แล้ว
pcoa result visualization by R
which R package can create Venn plot or Venn diagram and limitation: 7 packages for venn plot
มุมมอง 1.3K3 ปีที่แล้ว
which R package can create Venn plot or Venn diagram and limitation: 7 packages for venn plot
What is it like to be a freelancer as bioinformatic engineer for one year?生信分析员自由职业一周年感受与总结
มุมมอง 753 ปีที่แล้ว
What is it like to be a freelancer as bioinformatic engineer for one year?生信分析员自由职业一周年感受与总结
stacked bar chart types I have met and plot
มุมมอง 1113 ปีที่แล้ว
stacked bar chart types I have met and plot
what analysis you can do after qiime2: microbial community between white and black dental plague
มุมมอง 3463 ปีที่แล้ว
what analysis you can do after qiime2: microbial community between white and black dental plague
Using Ubuntu inside win 10 to install Qiime2
มุมมอง 2K4 ปีที่แล้ว
Using Ubuntu inside win 10 to install Qiime2
Things need to know before you start to analysis correlation network
มุมมอง 714 ปีที่แล้ว
Things need to know before you start to analysis correlation network
my top R using Packages 使用频率最高的R包?
มุมมอง 504 ปีที่แล้ว
my top R using Packages 使用频率最高的R包?
Quickly learn 8 types figures of Origin Origin 8种常见科研绘图教程
มุมมอง 7K4 ปีที่แล้ว
Quickly learn 8 types figures of Origin Origin 8种常见科研绘图教程
remove older version and install the latest qiime2 on mac
มุมมอง 1.2K4 ปีที่แล้ว
remove older version and install the latest qiime2 on mac
科研人员一定要学会的数据处理技巧-数据少的就用excel,多的就一定学学R-均值方差合并排序数据透视表
มุมมอง 654 ปีที่แล้ว
科研人员一定要学会的数据处理技巧-数据少的就用excel,多的就一定学学R-均值方差合并排序数据透视表
R语言分析成图大赏之16s测序/扩增子测序篇/科研绘图集锦/16s测序/扩增子测序/热图/venn/柱状累积图/差异分析/科研绘图/
มุมมอง 3844 ปีที่แล้ว
R语言分析成图大赏之16s测序/扩增子测序篇/科研绘图集锦/16s测序/扩增子测序/热图/venn/柱状累积图/差异分析/科研绘图/
network visualization by cytoscape tutorial based on group layout
มุมมอง 8K4 ปีที่แล้ว
network visualization by cytoscape tutorial based on group layout

ความคิดเห็น

  • @xyzpxwlabdog
    @xyzpxwlabdog 3 หลายเดือนก่อน

    內容挺好 可惜沒字幕

  • @ldsharma6546
    @ldsharma6546 4 หลายเดือนก่อน

    Hello mam, how do you prepare correlation matrix (heatmap) and a correlation network plot on 5:23

  • @ckhs1719
    @ckhs1719 5 หลายเดือนก่อน

    有興趣到台灣讀博士嗎? 你的專長與我實驗室的內容相同!

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 5 หลายเดือนก่อน

      硕士毕业8年了,不想继续了;如果你有学生需要学习这个,我可以帮忙指导

  • @muhammadshoaib-c2w
    @muhammadshoaib-c2w 5 หลายเดือนก่อน

    can you please help us to calculate OTU abundance with tutorial video.

  • @ceciliamlewski2313
    @ceciliamlewski2313 6 หลายเดือนก่อน

    nice video, but can you share some of your R script, did you use phyloseq?

  • @hikamiDjazz
    @hikamiDjazz 6 หลายเดือนก่อน

    Great pipeline, is the course available somewhere else? I'm mostly interested in the SEM R scripts/lectures

  • @eannatum
    @eannatum 7 หลายเดือนก่อน

    hallo, how did you create the file at 0:29? thanks

  • @honeydzikrimarhaeny9629
    @honeydzikrimarhaeny9629 8 หลายเดือนก่อน

    Why dont you show us how to prepare the nodes.txt file that contain mean abundance? It will make your tutorial clearly for the beginner.

  • @bayann7
    @bayann7 10 หลายเดือนก่อน

    I agree with you @firstep1363 The videos seems to be extremely useful. It would be great to make video in English, at least with subtitles

  • @kalalakanyanda8418
    @kalalakanyanda8418 10 หลายเดือนก่อน

    You're fast but thanks a lot for the information

  • @enriquep4857
    @enriquep4857 11 หลายเดือนก่อน

    Dear Lucy. How can i buy your curse?

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 11 หลายเดือนก่อน

      my email 983499199@qq.com

  • @오신근-y8k
    @오신근-y8k 11 หลายเดือนก่อน

    Do you have e-mail ? I want to have course but I want to ask you before I decide.

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 11 หลายเดือนก่อน

      983499199@qq.com

  • @dwiyannugraha
    @dwiyannugraha ปีที่แล้ว

    Share please

  • @dwiyannugraha
    @dwiyannugraha ปีที่แล้ว

    hi, can you share the program code

  • @john_wick-s2s
    @john_wick-s2s ปีที่แล้ว

    What does the length of the edge between node signifies

  • @asmaakamal9663
    @asmaakamal9663 ปีที่แล้ว

    Hi Lucy. Thank you so much for this amazing video . I have a problem , whenever I make adjustments in the excel file , they do not reflect in cytoscape , for example I write unclustered , it still appears empty at cytoscape so I can not group by cluster. Any thoughts ???

  • @nguyenvankhanhdhs301
    @nguyenvankhanhdhs301 ปีที่แล้ว

    Thank you for your video. How to export the sheet with "f" "p" "color" like in your video?

  • @adamsmabruk5627
    @adamsmabruk5627 ปีที่แล้ว

    can you share the table format or sample? Thanks

  • @mebratuify
    @mebratuify ปีที่แล้ว

    Can we get the video, please?. Thanks

  • @mebratuify
    @mebratuify ปีที่แล้ว

    Very good, but teach us how to do the pictures step by step using R-package. I hope many students will follow you. I want to do all those analyses by R-software. Thanks

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      most of my students are Chinese. Presently, 165.

  • @farmIntegral
    @farmIntegral ปีที่แล้ว

    Please how were you able to twerk the setting on Gephi to show positive and negative correlations using the edges?

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      when you import network, you can add a column to indicate it is positive or negative.

    • @farmIntegral
      @farmIntegral ปีที่แล้ว

      @@lucyzhang9850 Thanks for your prompt reply. However, how do you know from the network file which is a positive or negative correlation? Thanks for your insightful videos.

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      @@farmIntegral you need calculate the correlation first, then import them to gephi, check my gephi tutorial, to see the example input

    • @farmIntegral
      @farmIntegral ปีที่แล้ว

      @@lucyzhang9850 Thanks so much for your reply

  • @DrAkhtarAli08
    @DrAkhtarAli08 ปีที่แล้ว

    Great work Lucy

  • @dawzinmarsoe3505
    @dawzinmarsoe3505 ปีที่แล้ว

    Amazing video. Now I am analyzing the alpha diversity of bacterial community data by R. Please can share me a little how to organize the data to import the data to R.

  • @josephusophia
    @josephusophia ปีที่แล้ว

    it would be more practical if you could give a direct code example tho good content ✨ keep it up

  • @firstep1363
    @firstep1363 ปีที่แล้ว

    Thanks for the videos. But, unfortunately it is in Mandarin 😅 I don't understand at all !!! 😂. If I may to request, please provide the English version as well !!! 🙏 I hope you will always be healthy 🙏

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      part of my chinese students failed to install qiime2, I just tell them what they can do to successfully install it.

    • @firstep1363
      @firstep1363 ปีที่แล้ว

      ohh.. i see.. okeyyy.. good luck for your students 😊

  • @mdumar6479
    @mdumar6479 ปีที่แล้ว

    how did you genetrate this co-relation table

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      By R scripts. We have written some codes to calculate correlation and prepare node table

    • @safinahhakim8292
      @safinahhakim8292 ปีที่แล้ว

      do you have tutorial for the matrix before importing data to gephi@@lucyzhang9850 ?

  • @AkshayKumar-vd5wn
    @AkshayKumar-vd5wn ปีที่แล้ว

    Guys can you help? My R studio hangs everytime I open it. It only shows the R icon and stays here stuck.

  • @TaraGhimite
    @TaraGhimite ปีที่แล้ว

    👍👍

  • @meseretmuche6984
    @meseretmuche6984 ปีที่แล้ว

    please share us the command you did it

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      sorry about that, this is part of our selled-course. Can't share it for free.

  • @firstep1363
    @firstep1363 ปีที่แล้ว

    i hope there English version of this video 😅.. Nice to know you Lucy.. Hello from Indonesia..

  • @daveandrew
    @daveandrew ปีที่แล้ว

    How do you manage the two data sets (networks and node). Can I see ?

  • @daveandrew
    @daveandrew ปีที่แล้ว

    OmG I need English version please

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 ปีที่แล้ว

      check the new video, there is a english version

  • @Cleitonklt
    @Cleitonklt 2 ปีที่แล้ว

    The considered correlation value is above 0.5? I tried to my all data set and no group are formed.

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      the group layout is based on phylum

  • @zubairkhalid685
    @zubairkhalid685 2 ปีที่แล้ว

    The Udemy course says it's no longer accepting enrollment

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      Don't know how to handle things on udemy. If you want to buy course, you can send email to 983499199@qq.com

  • @Dispatern
    @Dispatern 2 ปีที่แล้ว

    Thank you very much!!

  • @lamalama7791
    @lamalama7791 2 ปีที่แล้ว

    I wish I can understand Chinese

  • @mergadaba4191
    @mergadaba4191 2 ปีที่แล้ว

    Good

  • @muhammadahmadihsan2212
    @muhammadahmadihsan2212 2 ปีที่แล้ว

    Waiting for your next video

  • @yuminnie5963
    @yuminnie5963 2 ปีที่แล้ว

    小姐姐 请问可以教一下r怎么利用r包运行excel里面的数据吗

  • @saubanmusazango2346
    @saubanmusazango2346 2 ปีที่แล้ว

    太棒了👏

  • @happylifebyanurakti4852
    @happylifebyanurakti4852 2 ปีที่แล้ว

    I really want to learn QIIME and R. If you can help me out Kindly provide me with your mail id

  • @happylifebyanurakti4852
    @happylifebyanurakti4852 2 ปีที่แล้ว

    Hey Lucy, i think i really need your help. Can you please provide me with your email

  • @jinjianwu3171
    @jinjianwu3171 2 ปีที่แล้ว

    讲解的很棒呀,加油

  • @saubanmusazango2346
    @saubanmusazango2346 2 ปีที่แล้ว

    我刚刚发现你的channel, keep it up. How can i contact you

  • @saubanmusazango2346
    @saubanmusazango2346 2 ปีที่แล้ว

    太棒了👏

  • @amyqing3253
    @amyqing3253 2 ปีที่แล้ว

    公众号多少啊,关注下

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      名字:不会画图请找我

  • @ahmedal-mammari9639
    @ahmedal-mammari9639 2 ปีที่แล้ว

    plz do you have wechat ID

  • @lucyzhang9850
    @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

    3500 yuan for the course, and including the R codes and tutorial videos, also the problem you meet with tele-guidance.The course includes 33 videos(1-10mins) with 59 R scripts, with which you can learn more than 80% microbial study analysis methods. It can save you at least 2000 hours. Also, when you meet problem to run the example data, it is free to ask for tele-guidance from an engineer with more than 13000 hour-experience. . send me 983499199@qq.com for full course material or further information. 也有中文课,中文更方便了,百度网盘,有QQ群!!

  • @kalonjiabondance9428
    @kalonjiabondance9428 2 ปีที่แล้ว

    Hi Lucy Thank you for these videos, very informative :) I would like to find out if you can make hands on tutorial where we can see how you generate these beautiful figures in R etc...

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      I was trying to upload on udemy. it is under reviewing

  • @najibabdellaoui6442
    @najibabdellaoui6442 2 ปีที่แล้ว

    hello, how can get the workshop for qiime2 and rstudio?

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      Qiime2 course don't have english version yet. I sold video course on Taobao. I don't know whether you guys can buy it.

    • @najibabdellaoui6442
      @najibabdellaoui6442 2 ปีที่แล้ว

      @@lucyzhang9850 ah i see, do u have any other videos to sell for english speaking or the scripts for microbiome data?

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      @@najibabdellaoui6442 yes,I have record full course of pipeline of R after qiime2; But I don't know how to sell. All plot in this video has course video and script

    • @najibabdellaoui6442
      @najibabdellaoui6442 2 ปีที่แล้ว

      @@lucyzhang9850 do u have paypal?

    • @lucyzhang9850
      @lucyzhang9850 2 ปีที่แล้ว

      @@najibabdellaoui6442 do you have any Chinese friend, maybe you can ask them to help to pay on alipay