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Travel to the heart of the living world
France
เข้าร่วมเมื่อ 12 มี.ค. 2014
This web channel presents methods and concepts of structural biology for NON-physicists interested in a travel to the molecules of life.
It was first designed from the videos of the MOOC and the book "Journey to the heart of life with X-rays: crystallography".
We continue to improve it with videos that present the other approaches of structural biology, Cryo-EM and NMR, as well as the associated theoretical concepts: Fourier transform, correlation coefficients...
It was first designed from the videos of the MOOC and the book "Journey to the heart of life with X-rays: crystallography".
We continue to improve it with videos that present the other approaches of structural biology, Cryo-EM and NMR, as well as the associated theoretical concepts: Fourier transform, correlation coefficients...
La préparation des échantillons biologiques : 2/ Choisir concrètement son système d'expression
Vous étudiez une nouvelle protéine en biologie structurale, et souhaitez la produire sous forme recombinante en quantité adaptée à la méthode de votre choix.
Dans cette nouvelle vidéo, le Dr Karine Blondeau vous présente ce que chaque système d'expression implique sur le plan expérimental.
Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr
Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous !!
Les chapitres de cette vidéo :
0:00 Jingle
0:25 Critères
0:50 Production en E coli
2:06 Production en cellules d'insecte
4:44 Production en levure
6:57 Production en cellules de mammifère
8:43 Expression in vitro
10:09 Production en levure de boulangerie
11:25 Conclusion
Dans cette nouvelle vidéo, le Dr Karine Blondeau vous présente ce que chaque système d'expression implique sur le plan expérimental.
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Les chapitres de cette vidéo :
0:00 Jingle
0:25 Critères
0:50 Production en E coli
2:06 Production en cellules d'insecte
4:44 Production en levure
6:57 Production en cellules de mammifère
8:43 Expression in vitro
10:09 Production en levure de boulangerie
11:25 Conclusion
มุมมอง: 117
วีดีโอ
La préparation des échantillons biologiques : 1/ Quel système d'expression pour quel projet ?
มุมมอง 543 หลายเดือนก่อน
Vous étudiez une nouvelle protéine en biologie structurale, et vous souhaitez la produire sous forme recombinante en quantité adaptée à la méthode d’étude votre choix. Dans cette première vidéo, pour vous aider à choisir l’outil de production le plus approprié. le Dr Karine Blondeau inventorie les différents systèmes de production afin de les comparer entre eux. 0:00 Jingle 2:52 Les critères de...
Production de protéines in vitro
มุมมอง 813ปีที่แล้ว
Comment produire une protéine en milieu acellulaire ? Dans cette vidéo, nous vous présentons les différentes étapes qui permettent de préparer des extraits de germes de blé, selon un protocole publié par Kazuyuki Takai en 2010 : Takai K, Sawasaki T, Endo Y. Practical cell-free protein synthesis system using purified wheat embryos. Nat Protoc. 2010 Feb;5(2):227-38. doi: 10.1038/nprot.2009.207, e...
Voyage dans l'univers des protéines
มุมมอง 409ปีที่แล้ว
Les protéines constituent les êtres vivants. Elles sont dans les cellules de la plante, dans les virus et les bactéries, dans les êtres aquatique et terrestre. Elles sont dans nos muscles, dans notre sang, nos cheveux, nos larmes, notre salive, notre cerveau, notre estomac. En quelques minutes nous vous proposons un voyage dans l'univers extraordinaire des protéines. La vidéo est en français, s...
PROTÉINES - Chapitre 5 : Comment étudie-t-on les protéines ?
มุมมอง 407ปีที่แล้ว
Pour comprendre comment fonctionne une protéine, il faut d’abord connaître sa forme, savoir comment les atomes des acides aminés qui la composent sont organisés dans l’espace, ce qu’on appelle sa structure tridimensionnelle.
PROTÉINES - Chapitre 4 : Comment fonctionnent les protéines ?
มุมมอง 433ปีที่แล้ว
Les protéines sont destinées à réagir avec leur environnement. Certaines finissent par se lier à des molécules ou d’autres protéines pour transmettre une information. D’autres comme les enzymes ont la capacité de faciliter des réactions chimiques. Mais comment fonctionnent-elle?
PROTÉINES - Chapitre 3 : Comment sont fabriquées les protéines ?
มุมมอง 934ปีที่แล้ว
Toutes sortes de signaux informent la cellule qu’il faut produire une nouvelle protéine. Quel que soit le signal, cette production d’une protéine commence dans le noyau de la cellule, là où se trouve les chaînes d’ADN, constituées de l’enchainement des nucléotides et enroulées en hélice, qui contiennent tous les gènes. Chaque gène correspond à un fragment d’ADN et cette succession de nucléotide...
PROTÉINES - Chapitre 2 : A quoi servent les protéines ?
มุมมอง 1.7Kปีที่แล้ว
Les cellules utilisent des protéines, fabriquent des protéines, et sont en partie constituées de protéines. Chacune de ces protéines possède une qualité spécifique comme celle de fixer des molécules chimiques, se modifier lors de la rencontre d’une molécule, faciliter la transformation d’une molécule en une autre, devenir des éléments de construction des cellules ou de protéger d’autres protéin...
PROTÉINES - Chapitre 1 : Qu est ce qu'une protéine ?
มุมมอง 6Kปีที่แล้ว
Les protéines sont constituées de centaines, voire de milliers d'atomes, assemblés sous forme d’acides aminés, eux-mêmes reliés entre eux pour former une chaine protéique. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter notre site bilingue français-anglais www.biostine.fr Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous !!
Petite histoire de l'informatique
มุมมอง 9863 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Alain Roussel, de l'AFMB à l'Université d'Aix-Marseille, nous raconte l'histoire de l'informatique. Vous souhaitez aller plus loin ? Un livre en format numérique ou papier reprend l'ensemble de ce cours : En français : vu.fr/ZwSgc ou en anglais : bit.ly/3zBC6p5 Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français...
Introduction à LINUX
มุมมอง 3403 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Alain Roussel, de l'AFMB à l'Université d'Aix-Marseille, nous explique les bases du LINUX. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr Pour vous familiariser d'avantage à LINUX, vous pouvez suivre un ensemble de cours et d'exercices en suivant le lien : sandboxbio.france-bioinform...
Coefficient de corrélation : 1/ Définition
มุมมอง 5003 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Dominique Housset, de l'IBS à l'Université de Grenoble, nous explique ce qu'est un coefficient de corrélation et ce qu'il peut apporter en biologie structurale. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous !! Les chapitres ...
Coefficient de corrélation : 2/ Applications
มุมมอง 2003 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Dominique Housset, de l'IBS à l'Université de Grenoble, nous montre quelques applications du coefficient de corrélation. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous !! Les chapitres de cette vidéo : 0:00 Introduction 0:24 ...
Modèles structuraux : 1/ Comment les observer, comment les interpréter ?
มุมมอง 4743 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Gerlind Sulzenbacher, de l'AFMB à l'université d'Aix-Marseille, nous explique comment récupérer un modèle tridimensionnel et comment l'observer. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous !! Les chapitres de cette vidéo :...
Modèles structuraux : 2/ Évaluer la qualité d'un modèle
มุมมอง 2843 ปีที่แล้ว
En quelques minutes le Dr Gerlind Sulzenbacher, de l'AFMB à l'Université d'Aix-Marseille, nous explique comment évaluer la qualité d'un modèle tridimensionnel d'une structure de macromolécule biologique. Pour une introduction plus complète à la biologie structurale n'hésitez à consulter le site bilingue français-anglais www.biostine.fr Et pour être au courant des nouvelles vidéos, abonnez-vous ...
Introduction à la RMN : première partie
มุมมอง 12K3 ปีที่แล้ว
Introduction à la RMN : première partie
Introduction à la diffusion des rayons X aux petits angles
มุมมอง 1.5K3 ปีที่แล้ว
Introduction à la diffusion des rayons X aux petits angles
Introduction à la Cryo-EM couplée à l'analyse d'images : première partie
มุมมอง 5843 ปีที่แล้ว
Introduction à la Cryo-EM couplée à l'analyse d'images : première partie
Introduction à la Cryo-EM couplée à l'analyse d'images : deuxième partie
มุมมอง 4213 ปีที่แล้ว
Introduction à la Cryo-EM couplée à l'analyse d'images : deuxième partie
8.1 Introduction to the Fourier transform
มุมมอง 7K4 ปีที่แล้ว
8.1 Introduction to the Fourier transform
8.2 The Fourier transform and the phase problem
มุมมอง 2K4 ปีที่แล้ว
8.2 The Fourier transform and the phase problem
11.1 Experimental phasing: isomorphic replacement
มุมมอง 4324 ปีที่แล้ว
11.1 Experimental phasing: isomorphic replacement
11.2 Experimental phasing: anomalous diffusion
มุมมอง 5784 ปีที่แล้ว
11.2 Experimental phasing: anomalous diffusion
12. Phase improvement and model building
มุมมอง 2544 ปีที่แล้ว
12. Phase improvement and model building
13. Model refinement, interpretation and evaluation
มุมมอง 4454 ปีที่แล้ว
13. Model refinement, interpretation and evaluation
Merci ca à résumé mon cours de biologie en plus facile 🥰🙏
la video est extraordinaire
Le facteur R est pertinent en cristallographie, car, du fait de la transformée de Fourier sur un objet périodique, on compare des valeurs discrètes de l'espace réciproque, valeurs que l'on peut par ailleurs calculer mathématiquement à partir des coordonnées des atomes (de leurs facteurs de diffusion élémentaire, de leur occupation, facteur d'agitation thermique). Ce facteur R restera pertinent dans l'espace de Fourier, ce qui implique de pouvoir calculer la contribution à la diffraction d'un modèle. La comparaison d'images se fait, quant à elle, dans l'espace direct qui est un espace continu et, de fait, le facteur R n'a plus beaucoup de sens et la corrélation devient un meilleur indicateur.
Bonjour, proposez-vous des cours en vidéo sur le principe de fonctionnement des appareils DRX (preparation et usage des fiches internationnal etc..) et leurs maintenance ? Merci beaucoup pour cette vidéo
Merci de votre message. Malheureusement non, je ne propose rien sur les appareils DRX.
Merci pour votre explication
je vous remercier pour le partage de l'info ...c'est très intéressant ....
Je n'ai pas réussi à comprendre tout, mais j'avoue que vous expliquez très bien
iléou le quizz wsh
Il n'est pas sur TH-cam. Je le proposerai bientôt sur un site web
Merci beaucoup pour cette vidéo, j'ai vraiment galéré à trouver le protocole correctement expliqué sur internet !
Très bien et Clairement expliqué, je vous remercie
Merci beaucoup pour votre commentaire
Merci beaucoup
Avec plaisir
@@voyageaucoeurduvivant7896 SVP vous pouvez m'expliquer la notion de réduction des données de diffraction avec un logiciel
Merci beaucoup professeur. Je comprends beaucoup de choses grâce à vos vidéos. Merci pour votre temps consacré à nous. j'ai un problème, qu'est-ce que la réduction des données de diffraction? Je suis confus
Bonjour, Je pense que la réponse est en grande partie dans la vidéo sur le traitement des données : th-cam.com/video/AnVEJ_oSq1I/w-d-xo.html Re-postez un commentaire si ça ne suffit pas à répondre à votre question.
@@voyageaucoeurduvivant7896 Merci beaucoup
vous avez un don pour expliquer tout en simplifiant les choses, merci beaucoup
Merci beaucoup
Merci Madame pour vos vidéos très explicite. A la 4:42 sec, vous dites que chaque signal répété à 6 pics, j'en vois 9. Est ce une erreur? ou je me trompe sur le terme pic d'une fonction? Merci
Bonjour, Merci de votre message. En fait, au total il y a même 12 pics, dont 4 qui sont très petits. Mais je dis "chaque signal répété contient 6 pics" parce qu'on a deux fois le même motif, on deux répétitions du même motif. Et donc, pour un motif donné on a 6 pics avec le même espacement entre les pics, dont deux pics tout petits. J'espère que ça répond à votre question.
Présentation très claire merci
Merci à vous
Un grand bravo pour votre vidéo extrêmement didactique pour les personnes comme moi qui sont éloignées du sujet. En trois minutes j'ai compris tout l'enchaînement. Vos explications sont d'une telle limpidité, j'ai presque l'impression d'être devenu un spécialiste :). Il reste sans doute beaucoup de chemin jusque là et dans tous les cas MILLE MERCIS !
Bonjour, Merci de votre message super gentil. N'hésitez pas à regarder les vidéos des 4 autres petits chapitres, ou celle qui contient tous les chapitres sur les protéines : th-cam.com/video/W4uZ2xrS4Gs/w-d-xo.html Les deux vidéos suivantes, sur la photosynthèse et les bioénergies, pourraient peut-être vous intéresser aussi : th-cam.com/video/sEPm37VRePs/w-d-xo.html th-cam.com/video/5UlLIIqUoSU/w-d-xo.html
merci beaucoup pour ses informations bien detaillle
Merci à vous
Bonjour, merci pour la vidéo. J’avais juste une question, comment augmente-t-on la concentration d’une protéine dans un solvant s’il vous plait
Bonjour, Il y a plusieurs façons de procéder : par filtration sur une membrane dont le cut-off est d'une taille inférieure à celle de votre protéine, ; par dialyse contre une solution plus salée que votre solution protéique ; ou encore par précipitation et re-solubilisation. Chaque méthode a ses avantages et risques associés.
i love proteins
C'était très clair, merci beaucoup madame
Merci à vous
Bonjour, N'est-il pas possible d'utiliser les données de diffraction pour en déduire directement la longueur de l'arête de la maille et la structure du cristal, avec une formule un peu plus complexe que L=2 λD/a ? Pourquoi est-il obligatoire de passer par la carte de densité électronique?
Bonjour, Vous avez tout à fait raison. Vous pouvez avoir plus d'infos à ce sujet dans la vidéo : th-cam.com/video/YjKhznck8f0/w-d-xo.html
Bonjour Madame, merci pour votre vidéo. C'est quel niveau d'étude qui est enseigné dans cette vidéo ?
Bonjour, Le niveau est clairement universitaire. Selon les bases scientifiques que vous avez, elle peut vous intéresser dès le premier cycle universitaire. Les étudiants avec lesquels j'ai utilisé la vidéo étaient plutôt en Master.
@@voyageaucoeurduvivant7896 Merci pour votre réponse.
Très bien fait ! Bravo !
Merci
Merci madame
Merci à vous
merci pour cette présentation
Merci à vous
Si je peux avoir beaucoup de vidéos sur ce domaine
Vous pouvez parcourir ma chaine, il y aura peut-être d'autres vidéos qui vous intéresseront, comme la 2.2 : clonage, production, purification des échantillons
@@voyageaucoeurduvivant7896 Merci pour vos conseils Je suis doctorant au Sénégal dans ce domaine, vous imaginez faite ce domaine dans un pays en voie de développement. Mais merci encore quand même pour vos conseils
@@Nancy-France2492 Merci pour votre message. C'est précisément pour que des personnes du monde entier puisse en profiter que je mets ces vidéos en ligne. Bonne continuation
@@voyageaucoeurduvivant7896 Merci Je travaille sur la Neuropiline-1 cocristallisée avec le peptide KDKPPR et la Candida Antarctica lipase B cocristallisée avec la Lysine
like it
Thank you
Bonjour et merci pour vos vidéos, c'est bien intéressant ! Je me rends compte que j'ai cependant des doutes au niveau du vocabulaire. Par exemple à 1:20 sur la loi de Bragg "conditions d'interférence constructive" -> figure de diffraction. Pourquoi ne parle-t-on pas de figure d'interférence ? Par ailleurs, en parlant de diffraction aux rayons X, on mesure le diamètre de chaque atome (diffraction par 1 trou ou 1 entité) tandis qu'il faudrait utiliser le phénomène d'interférence pour mesurer la distance séparant 2 atomes d'un cristal (analogie avec les fentes d'Young ou un réseau -> réseau cristallin). Mais je n'ai jamais entendu parler "d'interférence aux rayons X", uniquement de DRX. Pourriez-vous m'expliquer si je fais une erreur quelque part svp ?
Bonjour, Merci de votre message. En décrivant la loi de Bragg, on met en évidence les conditions dans lesquelles une interférence constructive peut se produire. La figure d'interférence sera plus le résultat global enregistré sur un détecteur. Je vous recommande la vidéo sur la loi de Bragg : th-cam.com/video/YjKhznck8f0/w-d-xo.html Elle pourra peut-être répondre à vos questions.
merci beaucoup ca c trés interessant j'espere que vous continuer
Merci à vous
first
trop cool
Merci à vous
Merci bcp pour ce cours! Superbe
Ravie que ça vous convienne
Très intéressant! Merci beaucoup
Merci à vous
Merci madame c'est très intéressant
Merci à vous
J'adore !
Merci
Thanks soo much
Merci à vus
0:36 Une glycine avec 6 atomes d'hydrogène? Il semble y avoir une erreur. Aussi sur la structure de la glycine vous avez mis 3 hydrogènes au lieu de deux à la fonction amine, la double liaison C=O manque et l'hydrogène de OH n'y est pas non plus.
À pH physio l'A.A est sous la forme NH3+-HCR-COO-
Une vulgarisation des principes de la RMN bien adaptée. Prière d'en faire autant pour toutes les autres méthodes spectroscopiques pour l'identification des composés organiques.
Merci. On va essayer de répondre à votre demande
Merci beaucoup
Avec plaisir
Bjr madame.svp je la démonstration de nombre de motifs ou multiplié dans le cas du carbone graphite et merci bcp.
Merci à vous.
Explication très claire, Très grand Merci !
Avec plaisir
bien expliqué monsieur
Merci de votre commentaire
super cours. Merci pour la clarté des notions partagés.
Merci à vous
Mercii beaucoup ☺️
Avec plaisir 😊
merci pour l`information
Merci de votre commentaire
Bonjour, cette vidéo est prometteuse ; j'aimerais donc lire les épisodes précédents qui sont annoncés au début. Je n'ai malheureusement pas trouvé comment y accéder ; pourriez-vous me le préciser ? Merci.
Bonjour,Merci de votre commentaire. Les vidéos auxquelles je fais référence sont sur ma chaine. Il s'agit principalement des vidéos notées comme des chapitres : de 3 à 6.
Vraiment merci de partager ces connaissances avec tout le monde
Très bien expliqué, merci beaucoup !
Merci